Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL02

Trio, Triple functional domain protein, mousemouse

Predictions only

Length 3,102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrioQ0KL02 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TrioQ0KL02 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
TrioQ0KL02 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TrioQ0KL02 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TrioQ0KL02 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
TrioQ0KL02 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TrioQ0KL02 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TrioQ0KL02 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TrioQ0KL02 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TrioQ0KL02 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TrioQ0KL02 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TrioQ0KL02 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TrioQ0KL02 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TrioQ0KL02 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TrioQ0KL02 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TrioQ0KL02 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
TrioQ0KL02 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TrioQ0KL02 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TrioQ0KL02 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TrioQ0KL02 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TrioQ0KL02 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TrioQ0KL02 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TrioQ0KL02 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TrioQ0KL02 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TrioQ0KL02 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TrioQ0KL02 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TrioQ0KL02 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TrioQ0KL02 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TrioQ0KL02 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TrioQ0KL02 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TrioQ0KL02 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TrioQ0KL02 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TrioQ0KL02 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TrioQ0KL02 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TrioQ0KL02 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TrioQ0KL02 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TrioQ0KL02 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TrioQ0KL02 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TrioQ0KL02 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TrioQ0KL02 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TrioQ0KL02 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TrioQ0KL02 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TrioQ0KL02 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TrioQ0KL02 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
TrioQ0KL02 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TrioQ0KL02 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
TrioQ0KL02 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TrioQ0KL02 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TrioQ0KL02 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TrioQ0KL02 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TrioQ0KL02 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TrioQ0KL02 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TrioQ0KL02 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TrioQ0KL02 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TrioQ0KL02 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TrioQ0KL02 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TrioQ0KL02 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TrioQ0KL02 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TrioQ0KL02 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TrioQ0KL02 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
TrioQ0KL02 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TrioQ0KL02 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
TrioQ0KL02 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TrioQ0KL02 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TrioQ0KL02 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TrioQ0KL02 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TrioQ0KL02 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TrioQ0KL02 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TrioQ0KL02 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TrioQ0KL02 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TrioQ0KL02 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TrioQ0KL02 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TrioQ0KL02 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TrioQ0KL02 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TrioQ0KL02 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
TrioQ0KL02 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TrioQ0KL02 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
TrioQ0KL02 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TrioQ0KL02 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
TrioQ0KL02 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TrioQ0KL02 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TrioQ0KL02 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TrioQ0KL02 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TrioQ0KL02 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TrioQ0KL02 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TrioQ0KL02 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TrioQ0KL02 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TrioQ0KL02 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TrioQ0KL02 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TrioQ0KL02 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TrioQ0KL02 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TrioQ0KL02 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TrioQ0KL02 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TrioQ0KL02 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TrioQ0KL02 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TrioQ0KL02 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TrioQ0KL02 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TrioQ0KL02 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TrioQ0KL02 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TrioQ0KL02 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93.8 ms