Protein–RNA interactions for Protein: Q08879

Fbln1, Fibulin-1, mousemouse

Predictions only

Length 705 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbln1Q08879 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Fbln1Q08879 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Fbln1Q08879 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Fbln1Q08879 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Fbln1Q08879 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Fbln1Q08879 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Fbln1Q08879 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Fbln1Q08879 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Fbln1Q08879 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Fbln1Q08879 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Fbln1Q08879 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Fbln1Q08879 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Fbln1Q08879 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Fbln1Q08879 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Fbln1Q08879 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Fbln1Q08879 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Fbln1Q08879 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Fbln1Q08879 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Fbln1Q08879 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Fbln1Q08879 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Fbln1Q08879 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Fbln1Q08879 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Fbln1Q08879 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Fbln1Q08879 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Fbln1Q08879 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Fbln1Q08879 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Fbln1Q08879 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Fbln1Q08879 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Fbln1Q08879 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Fbln1Q08879 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Fbln1Q08879 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Fbln1Q08879 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Fbln1Q08879 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Fbln1Q08879 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Fbln1Q08879 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Fbln1Q08879 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Fbln1Q08879 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Fbln1Q08879 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Fbln1Q08879 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Fbln1Q08879 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Fbln1Q08879 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Fbln1Q08879 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Fbln1Q08879 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Fbln1Q08879 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Fbln1Q08879 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Fbln1Q08879 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Fbln1Q08879 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Fbln1Q08879 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Fbln1Q08879 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Fbln1Q08879 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Fbln1Q08879 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Fbln1Q08879 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Fbln1Q08879 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Fbln1Q08879 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Fbln1Q08879 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Fbln1Q08879 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Fbln1Q08879 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Fbln1Q08879 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Fbln1Q08879 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Fbln1Q08879 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Fbln1Q08879 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Fbln1Q08879 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Fbln1Q08879 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Fbln1Q08879 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Fbln1Q08879 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Fbln1Q08879 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Fbln1Q08879 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Fbln1Q08879 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Fbln1Q08879 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Fbln1Q08879 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Fbln1Q08879 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Fbln1Q08879 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
Fbln1Q08879 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Fbln1Q08879 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Fbln1Q08879 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Fbln1Q08879 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Fbln1Q08879 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Fbln1Q08879 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Fbln1Q08879 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Fbln1Q08879 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Fbln1Q08879 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Fbln1Q08879 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Fbln1Q08879 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Fbln1Q08879 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Fbln1Q08879 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Fbln1Q08879 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Fbln1Q08879 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Fbln1Q08879 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Fbln1Q08879 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Fbln1Q08879 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Fbln1Q08879 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Fbln1Q08879 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Fbln1Q08879 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Fbln1Q08879 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Fbln1Q08879 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Fbln1Q08879 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Fbln1Q08879 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Fbln1Q08879 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Fbln1Q08879 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Fbln1Q08879 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms