Protein–RNA interactions for Protein: Q08624

Hoxc4, Homeobox protein Hox-C4, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc4Q08624 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hoxc4Q08624 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hoxc4Q08624 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Hoxc4Q08624 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Hoxc4Q08624 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Hoxc4Q08624 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Hoxc4Q08624 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Hoxc4Q08624 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Hoxc4Q08624 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Hoxc4Q08624 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Hoxc4Q08624 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Hoxc4Q08624 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Hoxc4Q08624 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Hoxc4Q08624 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hoxc4Q08624 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hoxc4Q08624 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hoxc4Q08624 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hoxc4Q08624 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hoxc4Q08624 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hoxc4Q08624 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hoxc4Q08624 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hoxc4Q08624 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Hoxc4Q08624 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Hoxc4Q08624 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Hoxc4Q08624 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Hoxc4Q08624 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Hoxc4Q08624 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Hoxc4Q08624 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Hoxc4Q08624 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Hoxc4Q08624 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Hoxc4Q08624 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Hoxc4Q08624 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Hoxc4Q08624 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Hoxc4Q08624 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Hoxc4Q08624 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Hoxc4Q08624 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hoxc4Q08624 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hoxc4Q08624 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hoxc4Q08624 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hoxc4Q08624 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hoxc4Q08624 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hoxc4Q08624 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hoxc4Q08624 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Hoxc4Q08624 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Hoxc4Q08624 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Hoxc4Q08624 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Hoxc4Q08624 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Hoxc4Q08624 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hoxc4Q08624 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hoxc4Q08624 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Hoxc4Q08624 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hoxc4Q08624 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Hoxc4Q08624 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Hoxc4Q08624 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Hoxc4Q08624 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Hoxc4Q08624 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Hoxc4Q08624 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Hoxc4Q08624 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Hoxc4Q08624 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Hoxc4Q08624 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hoxc4Q08624 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hoxc4Q08624 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hoxc4Q08624 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hoxc4Q08624 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Hoxc4Q08624 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Hoxc4Q08624 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Hoxc4Q08624 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Hoxc4Q08624 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Hoxc4Q08624 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Hoxc4Q08624 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Hoxc4Q08624 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Hoxc4Q08624 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Hoxc4Q08624 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Hoxc4Q08624 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Hoxc4Q08624 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Hoxc4Q08624 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Hoxc4Q08624 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Hoxc4Q08624 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Hoxc4Q08624 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Hoxc4Q08624 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Hoxc4Q08624 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Hoxc4Q08624 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Hoxc4Q08624 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Hoxc4Q08624 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Hoxc4Q08624 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Hoxc4Q08624 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hoxc4Q08624 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hoxc4Q08624 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hoxc4Q08624 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Hoxc4Q08624 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Hoxc4Q08624 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Hoxc4Q08624 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Hoxc4Q08624 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Hoxc4Q08624 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Hoxc4Q08624 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Hoxc4Q08624 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Hoxc4Q08624 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Hoxc4Q08624 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Hoxc4Q08624 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Hoxc4Q08624 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.9 ms