Protein–RNA interactions for Protein: Q08460

Kcnma1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnma1Q08460 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Kcnma1Q08460 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Kcnma1Q08460 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Kcnma1Q08460 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Kcnma1Q08460 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Kcnma1Q08460 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Kcnma1Q08460 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Kcnma1Q08460 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Kcnma1Q08460 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Kcnma1Q08460 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Kcnma1Q08460 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Kcnma1Q08460 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Kcnma1Q08460 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Kcnma1Q08460 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Kcnma1Q08460 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Kcnma1Q08460 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Kcnma1Q08460 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Kcnma1Q08460 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Kcnma1Q08460 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Kcnma1Q08460 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Kcnma1Q08460 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Kcnma1Q08460 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Kcnma1Q08460 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Kcnma1Q08460 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Kcnma1Q08460 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Kcnma1Q08460 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Kcnma1Q08460 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Kcnma1Q08460 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Kcnma1Q08460 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Kcnma1Q08460 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Kcnma1Q08460 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Kcnma1Q08460 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Kcnma1Q08460 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Kcnma1Q08460 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Kcnma1Q08460 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Kcnma1Q08460 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Kcnma1Q08460 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Kcnma1Q08460 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Kcnma1Q08460 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Kcnma1Q08460 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Kcnma1Q08460 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Kcnma1Q08460 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Kcnma1Q08460 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Kcnma1Q08460 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Kcnma1Q08460 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Kcnma1Q08460 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Kcnma1Q08460 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Kcnma1Q08460 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Kcnma1Q08460 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Kcnma1Q08460 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Kcnma1Q08460 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Kcnma1Q08460 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Kcnma1Q08460 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Kcnma1Q08460 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Kcnma1Q08460 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Kcnma1Q08460 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Kcnma1Q08460 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Kcnma1Q08460 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Kcnma1Q08460 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Kcnma1Q08460 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Kcnma1Q08460 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Kcnma1Q08460 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Kcnma1Q08460 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Kcnma1Q08460 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Kcnma1Q08460 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Kcnma1Q08460 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Kcnma1Q08460 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Kcnma1Q08460 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Kcnma1Q08460 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Kcnma1Q08460 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Kcnma1Q08460 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Kcnma1Q08460 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Kcnma1Q08460 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Kcnma1Q08460 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Kcnma1Q08460 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Kcnma1Q08460 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Kcnma1Q08460 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Kcnma1Q08460 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Kcnma1Q08460 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Kcnma1Q08460 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Kcnma1Q08460 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Kcnma1Q08460 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Kcnma1Q08460 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Kcnma1Q08460 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Kcnma1Q08460 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Kcnma1Q08460 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Kcnma1Q08460 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Kcnma1Q08460 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Kcnma1Q08460 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Kcnma1Q08460 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Kcnma1Q08460 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Kcnma1Q08460 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Kcnma1Q08460 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Kcnma1Q08460 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Kcnma1Q08460 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Kcnma1Q08460 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Kcnma1Q08460 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Kcnma1Q08460 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Kcnma1Q08460 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Kcnma1Q08460 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.7 ms