Protein–RNA interactions for Protein: Q07802

Ebf1, Transcription factor COE1, mousemouse

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ebf1Q07802 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Ebf1Q07802 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ebf1Q07802 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ebf1Q07802 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ebf1Q07802 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ebf1Q07802 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ebf1Q07802 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ebf1Q07802 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ebf1Q07802 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Ebf1Q07802 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ebf1Q07802 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ebf1Q07802 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ebf1Q07802 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ebf1Q07802 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ebf1Q07802 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ebf1Q07802 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ebf1Q07802 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Ebf1Q07802 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ebf1Q07802 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ebf1Q07802 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ebf1Q07802 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ebf1Q07802 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ebf1Q07802 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ebf1Q07802 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ebf1Q07802 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ebf1Q07802 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ebf1Q07802 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ebf1Q07802 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ebf1Q07802 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ebf1Q07802 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ebf1Q07802 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ebf1Q07802 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ebf1Q07802 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ebf1Q07802 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ebf1Q07802 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ebf1Q07802 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ebf1Q07802 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ebf1Q07802 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ebf1Q07802 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ebf1Q07802 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ebf1Q07802 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ebf1Q07802 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ebf1Q07802 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ebf1Q07802 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ebf1Q07802 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Ebf1Q07802 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ebf1Q07802 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ebf1Q07802 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ebf1Q07802 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ebf1Q07802 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ebf1Q07802 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ebf1Q07802 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ebf1Q07802 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ebf1Q07802 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ebf1Q07802 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ebf1Q07802 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ebf1Q07802 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ebf1Q07802 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ebf1Q07802 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ebf1Q07802 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ebf1Q07802 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ebf1Q07802 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ebf1Q07802 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ebf1Q07802 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ebf1Q07802 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ebf1Q07802 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ebf1Q07802 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ebf1Q07802 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ebf1Q07802 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ebf1Q07802 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ebf1Q07802 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ebf1Q07802 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ebf1Q07802 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ebf1Q07802 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ebf1Q07802 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ebf1Q07802 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ebf1Q07802 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ebf1Q07802 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Ebf1Q07802 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ebf1Q07802 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ebf1Q07802 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ebf1Q07802 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ebf1Q07802 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ebf1Q07802 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ebf1Q07802 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ebf1Q07802 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ebf1Q07802 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ebf1Q07802 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ebf1Q07802 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Ebf1Q07802 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ebf1Q07802 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ebf1Q07802 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ebf1Q07802 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ebf1Q07802 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ebf1Q07802 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ebf1Q07802 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ebf1Q07802 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Ebf1Q07802 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ebf1Q07802 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ebf1Q07802 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms