Protein–RNA interactions for Protein: Q04899

Cdk18, Cyclin-dependent kinase 18, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk18Q04899 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cdk18Q04899 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cdk18Q04899 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cdk18Q04899 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cdk18Q04899 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cdk18Q04899 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cdk18Q04899 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cdk18Q04899 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cdk18Q04899 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Cdk18Q04899 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cdk18Q04899 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cdk18Q04899 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cdk18Q04899 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cdk18Q04899 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Cdk18Q04899 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cdk18Q04899 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cdk18Q04899 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cdk18Q04899 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cdk18Q04899 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cdk18Q04899 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cdk18Q04899 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cdk18Q04899 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cdk18Q04899 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cdk18Q04899 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cdk18Q04899 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cdk18Q04899 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cdk18Q04899 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cdk18Q04899 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cdk18Q04899 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cdk18Q04899 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cdk18Q04899 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cdk18Q04899 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Cdk18Q04899 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cdk18Q04899 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cdk18Q04899 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cdk18Q04899 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Cdk18Q04899 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Cdk18Q04899 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cdk18Q04899 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cdk18Q04899 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Cdk18Q04899 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cdk18Q04899 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cdk18Q04899 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cdk18Q04899 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cdk18Q04899 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cdk18Q04899 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Cdk18Q04899 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Cdk18Q04899 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cdk18Q04899 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cdk18Q04899 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Cdk18Q04899 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Cdk18Q04899 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cdk18Q04899 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cdk18Q04899 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cdk18Q04899 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Cdk18Q04899 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cdk18Q04899 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cdk18Q04899 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cdk18Q04899 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cdk18Q04899 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Cdk18Q04899 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cdk18Q04899 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cdk18Q04899 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cdk18Q04899 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cdk18Q04899 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cdk18Q04899 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cdk18Q04899 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cdk18Q04899 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cdk18Q04899 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cdk18Q04899 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cdk18Q04899 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cdk18Q04899 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cdk18Q04899 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cdk18Q04899 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cdk18Q04899 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cdk18Q04899 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cdk18Q04899 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Cdk18Q04899 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cdk18Q04899 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cdk18Q04899 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cdk18Q04899 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cdk18Q04899 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cdk18Q04899 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Cdk18Q04899 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cdk18Q04899 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cdk18Q04899 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cdk18Q04899 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cdk18Q04899 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Cdk18Q04899 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cdk18Q04899 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cdk18Q04899 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cdk18Q04899 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cdk18Q04899 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cdk18Q04899 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cdk18Q04899 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cdk18Q04899 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cdk18Q04899 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cdk18Q04899 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cdk18Q04899 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cdk18Q04899 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms