Protein–RNA interactions for Protein: Q04447

Ckb, Creatine kinase B-type, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CkbQ04447 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CkbQ04447 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CkbQ04447 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CkbQ04447 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CkbQ04447 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CkbQ04447 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CkbQ04447 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CkbQ04447 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CkbQ04447 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CkbQ04447 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CkbQ04447 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CkbQ04447 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CkbQ04447 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CkbQ04447 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CkbQ04447 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CkbQ04447 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CkbQ04447 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CkbQ04447 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CkbQ04447 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CkbQ04447 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CkbQ04447 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CkbQ04447 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CkbQ04447 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CkbQ04447 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CkbQ04447 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CkbQ04447 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CkbQ04447 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CkbQ04447 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CkbQ04447 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CkbQ04447 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CkbQ04447 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CkbQ04447 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CkbQ04447 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CkbQ04447 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CkbQ04447 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CkbQ04447 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CkbQ04447 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CkbQ04447 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CkbQ04447 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CkbQ04447 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CkbQ04447 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CkbQ04447 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CkbQ04447 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CkbQ04447 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CkbQ04447 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CkbQ04447 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CkbQ04447 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CkbQ04447 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CkbQ04447 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CkbQ04447 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CkbQ04447 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CkbQ04447 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CkbQ04447 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CkbQ04447 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CkbQ04447 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CkbQ04447 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CkbQ04447 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CkbQ04447 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CkbQ04447 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CkbQ04447 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CkbQ04447 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CkbQ04447 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CkbQ04447 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CkbQ04447 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CkbQ04447 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CkbQ04447 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CkbQ04447 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CkbQ04447 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CkbQ04447 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CkbQ04447 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CkbQ04447 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CkbQ04447 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CkbQ04447 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CkbQ04447 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CkbQ04447 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CkbQ04447 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CkbQ04447 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CkbQ04447 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CkbQ04447 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CkbQ04447 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CkbQ04447 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CkbQ04447 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CkbQ04447 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CkbQ04447 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CkbQ04447 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CkbQ04447 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CkbQ04447 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CkbQ04447 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CkbQ04447 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CkbQ04447 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CkbQ04447 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CkbQ04447 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CkbQ04447 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CkbQ04447 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CkbQ04447 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CkbQ04447 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CkbQ04447 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CkbQ04447 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CkbQ04447 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CkbQ04447 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11 ms