Protein–RNA interactions for Protein: Q03358

Msx2, Homeobox protein MSX-2, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msx2Q03358 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Msx2Q03358 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Msx2Q03358 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Msx2Q03358 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Msx2Q03358 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Msx2Q03358 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Msx2Q03358 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Msx2Q03358 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Msx2Q03358 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Msx2Q03358 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Msx2Q03358 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Msx2Q03358 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Msx2Q03358 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Msx2Q03358 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Msx2Q03358 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Msx2Q03358 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Msx2Q03358 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Msx2Q03358 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Msx2Q03358 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Msx2Q03358 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Msx2Q03358 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Msx2Q03358 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Msx2Q03358 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Msx2Q03358 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Msx2Q03358 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Msx2Q03358 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Msx2Q03358 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Msx2Q03358 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Msx2Q03358 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Msx2Q03358 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Msx2Q03358 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Msx2Q03358 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Msx2Q03358 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Msx2Q03358 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Msx2Q03358 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Msx2Q03358 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Msx2Q03358 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Msx2Q03358 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Msx2Q03358 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Msx2Q03358 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Msx2Q03358 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Msx2Q03358 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Msx2Q03358 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Msx2Q03358 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Msx2Q03358 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Msx2Q03358 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Msx2Q03358 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Msx2Q03358 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Msx2Q03358 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Msx2Q03358 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Msx2Q03358 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Msx2Q03358 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Msx2Q03358 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Msx2Q03358 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Msx2Q03358 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Msx2Q03358 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Msx2Q03358 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Msx2Q03358 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Msx2Q03358 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Msx2Q03358 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Msx2Q03358 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Msx2Q03358 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Msx2Q03358 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Msx2Q03358 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Msx2Q03358 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Msx2Q03358 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Msx2Q03358 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Msx2Q03358 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Msx2Q03358 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Msx2Q03358 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Msx2Q03358 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Msx2Q03358 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Msx2Q03358 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Msx2Q03358 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Msx2Q03358 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Msx2Q03358 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Msx2Q03358 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Msx2Q03358 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Msx2Q03358 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Msx2Q03358 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Msx2Q03358 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Msx2Q03358 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Msx2Q03358 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Msx2Q03358 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Msx2Q03358 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Msx2Q03358 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Msx2Q03358 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Msx2Q03358 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Msx2Q03358 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Msx2Q03358 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Msx2Q03358 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Msx2Q03358 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Msx2Q03358 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Msx2Q03358 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Msx2Q03358 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Msx2Q03358 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Msx2Q03358 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Msx2Q03358 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Msx2Q03358 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Msx2Q03358 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms