Protein–RNA interactions for Protein: Q01965

Ly9, T-lymphocyte surface antigen Ly-9, mousemouse

Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ly9Q01965 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ly9Q01965 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ly9Q01965 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ly9Q01965 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ly9Q01965 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ly9Q01965 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ly9Q01965 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ly9Q01965 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ly9Q01965 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ly9Q01965 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ly9Q01965 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ly9Q01965 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ly9Q01965 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ly9Q01965 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ly9Q01965 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ly9Q01965 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ly9Q01965 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ly9Q01965 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ly9Q01965 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ly9Q01965 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ly9Q01965 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ly9Q01965 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ly9Q01965 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ly9Q01965 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ly9Q01965 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ly9Q01965 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ly9Q01965 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ly9Q01965 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ly9Q01965 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ly9Q01965 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ly9Q01965 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ly9Q01965 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ly9Q01965 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ly9Q01965 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ly9Q01965 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ly9Q01965 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ly9Q01965 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Ly9Q01965 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ly9Q01965 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ly9Q01965 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ly9Q01965 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ly9Q01965 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ly9Q01965 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ly9Q01965 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ly9Q01965 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ly9Q01965 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ly9Q01965 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ly9Q01965 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ly9Q01965 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ly9Q01965 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ly9Q01965 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ly9Q01965 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ly9Q01965 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ly9Q01965 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ly9Q01965 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Ly9Q01965 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ly9Q01965 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ly9Q01965 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ly9Q01965 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ly9Q01965 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ly9Q01965 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Ly9Q01965 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ly9Q01965 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ly9Q01965 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ly9Q01965 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ly9Q01965 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ly9Q01965 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ly9Q01965 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ly9Q01965 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ly9Q01965 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ly9Q01965 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Ly9Q01965 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ly9Q01965 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ly9Q01965 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ly9Q01965 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ly9Q01965 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ly9Q01965 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ly9Q01965 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ly9Q01965 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ly9Q01965 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ly9Q01965 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ly9Q01965 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ly9Q01965 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ly9Q01965 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ly9Q01965 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ly9Q01965 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ly9Q01965 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Ly9Q01965 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Ly9Q01965 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ly9Q01965 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ly9Q01965 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ly9Q01965 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ly9Q01965 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ly9Q01965 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ly9Q01965 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ly9Q01965 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ly9Q01965 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ly9Q01965 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ly9Q01965 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ly9Q01965 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms