Protein–RNA interactions for Protein: Q01098

Grin2c, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2C, mousemouse

Predictions only

Length 1,239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2cQ01098 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Grin2cQ01098 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Grin2cQ01098 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Grin2cQ01098 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Grin2cQ01098 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Grin2cQ01098 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Grin2cQ01098 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Grin2cQ01098 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Grin2cQ01098 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Grin2cQ01098 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Grin2cQ01098 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Grin2cQ01098 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Grin2cQ01098 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Grin2cQ01098 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Grin2cQ01098 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Grin2cQ01098 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Grin2cQ01098 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Grin2cQ01098 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Grin2cQ01098 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Grin2cQ01098 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Grin2cQ01098 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Grin2cQ01098 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Grin2cQ01098 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Grin2cQ01098 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Grin2cQ01098 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Grin2cQ01098 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Grin2cQ01098 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Grin2cQ01098 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Grin2cQ01098 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Grin2cQ01098 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Grin2cQ01098 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Grin2cQ01098 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Grin2cQ01098 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Grin2cQ01098 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Grin2cQ01098 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Grin2cQ01098 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Grin2cQ01098 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Grin2cQ01098 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Grin2cQ01098 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Grin2cQ01098 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Grin2cQ01098 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Grin2cQ01098 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Grin2cQ01098 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Grin2cQ01098 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Grin2cQ01098 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Grin2cQ01098 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Grin2cQ01098 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Grin2cQ01098 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Grin2cQ01098 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Grin2cQ01098 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Grin2cQ01098 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Grin2cQ01098 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Grin2cQ01098 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Grin2cQ01098 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Grin2cQ01098 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Grin2cQ01098 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Grin2cQ01098 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Grin2cQ01098 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Grin2cQ01098 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Grin2cQ01098 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Grin2cQ01098 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Grin2cQ01098 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Grin2cQ01098 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Grin2cQ01098 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Grin2cQ01098 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Grin2cQ01098 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Grin2cQ01098 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Grin2cQ01098 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Grin2cQ01098 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Grin2cQ01098 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Grin2cQ01098 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Grin2cQ01098 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Grin2cQ01098 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Grin2cQ01098 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Grin2cQ01098 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Grin2cQ01098 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Grin2cQ01098 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Grin2cQ01098 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Grin2cQ01098 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Grin2cQ01098 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Grin2cQ01098 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Grin2cQ01098 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Grin2cQ01098 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Grin2cQ01098 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Grin2cQ01098 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Grin2cQ01098 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Grin2cQ01098 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Grin2cQ01098 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Grin2cQ01098 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Grin2cQ01098 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Grin2cQ01098 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Grin2cQ01098 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Grin2cQ01098 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Grin2cQ01098 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Grin2cQ01098 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Grin2cQ01098 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Grin2cQ01098 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Grin2cQ01098 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Grin2cQ01098 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Grin2cQ01098 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms