Protein–RNA interactions for Protein: Q01065

Pde1b, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1B, mousemouse

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde1bQ01065 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pde1bQ01065 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pde1bQ01065 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pde1bQ01065 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Pde1bQ01065 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pde1bQ01065 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pde1bQ01065 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Pde1bQ01065 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pde1bQ01065 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pde1bQ01065 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Pde1bQ01065 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pde1bQ01065 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pde1bQ01065 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pde1bQ01065 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pde1bQ01065 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pde1bQ01065 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pde1bQ01065 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pde1bQ01065 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pde1bQ01065 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pde1bQ01065 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Pde1bQ01065 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pde1bQ01065 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pde1bQ01065 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pde1bQ01065 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pde1bQ01065 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pde1bQ01065 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pde1bQ01065 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pde1bQ01065 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pde1bQ01065 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pde1bQ01065 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pde1bQ01065 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pde1bQ01065 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pde1bQ01065 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pde1bQ01065 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pde1bQ01065 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pde1bQ01065 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pde1bQ01065 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pde1bQ01065 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pde1bQ01065 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pde1bQ01065 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pde1bQ01065 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pde1bQ01065 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pde1bQ01065 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pde1bQ01065 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pde1bQ01065 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pde1bQ01065 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pde1bQ01065 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pde1bQ01065 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pde1bQ01065 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pde1bQ01065 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pde1bQ01065 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pde1bQ01065 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pde1bQ01065 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pde1bQ01065 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pde1bQ01065 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pde1bQ01065 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Pde1bQ01065 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Pde1bQ01065 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pde1bQ01065 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pde1bQ01065 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pde1bQ01065 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Pde1bQ01065 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pde1bQ01065 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pde1bQ01065 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pde1bQ01065 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pde1bQ01065 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pde1bQ01065 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pde1bQ01065 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pde1bQ01065 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pde1bQ01065 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pde1bQ01065 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pde1bQ01065 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pde1bQ01065 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pde1bQ01065 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pde1bQ01065 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pde1bQ01065 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pde1bQ01065 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pde1bQ01065 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pde1bQ01065 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pde1bQ01065 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pde1bQ01065 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.31
Pde1bQ01065 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pde1bQ01065 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pde1bQ01065 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pde1bQ01065 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pde1bQ01065 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pde1bQ01065 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pde1bQ01065 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pde1bQ01065 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pde1bQ01065 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pde1bQ01065 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pde1bQ01065 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pde1bQ01065 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pde1bQ01065 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pde1bQ01065 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pde1bQ01065 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pde1bQ01065 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pde1bQ01065 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pde1bQ01065 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pde1bQ01065 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms