Protein–RNA interactions for Protein: Q00915

Rbp1, Retinol-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp1Q00915 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rbp1Q00915 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rbp1Q00915 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rbp1Q00915 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rbp1Q00915 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rbp1Q00915 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rbp1Q00915 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rbp1Q00915 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rbp1Q00915 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rbp1Q00915 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Rbp1Q00915 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rbp1Q00915 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rbp1Q00915 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rbp1Q00915 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rbp1Q00915 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rbp1Q00915 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rbp1Q00915 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rbp1Q00915 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rbp1Q00915 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rbp1Q00915 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rbp1Q00915 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rbp1Q00915 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rbp1Q00915 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Rbp1Q00915 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rbp1Q00915 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rbp1Q00915 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rbp1Q00915 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rbp1Q00915 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rbp1Q00915 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rbp1Q00915 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rbp1Q00915 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rbp1Q00915 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rbp1Q00915 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rbp1Q00915 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rbp1Q00915 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rbp1Q00915 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rbp1Q00915 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rbp1Q00915 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rbp1Q00915 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rbp1Q00915 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rbp1Q00915 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rbp1Q00915 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Rbp1Q00915 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Rbp1Q00915 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rbp1Q00915 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rbp1Q00915 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rbp1Q00915 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rbp1Q00915 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rbp1Q00915 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rbp1Q00915 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rbp1Q00915 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Rbp1Q00915 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rbp1Q00915 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rbp1Q00915 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Rbp1Q00915 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rbp1Q00915 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rbp1Q00915 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rbp1Q00915 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rbp1Q00915 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rbp1Q00915 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rbp1Q00915 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rbp1Q00915 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rbp1Q00915 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rbp1Q00915 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rbp1Q00915 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rbp1Q00915 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rbp1Q00915 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rbp1Q00915 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rbp1Q00915 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Rbp1Q00915 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rbp1Q00915 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rbp1Q00915 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rbp1Q00915 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rbp1Q00915 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rbp1Q00915 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rbp1Q00915 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rbp1Q00915 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rbp1Q00915 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rbp1Q00915 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rbp1Q00915 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Rbp1Q00915 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rbp1Q00915 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rbp1Q00915 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rbp1Q00915 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rbp1Q00915 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rbp1Q00915 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Rbp1Q00915 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rbp1Q00915 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rbp1Q00915 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rbp1Q00915 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rbp1Q00915 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rbp1Q00915 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rbp1Q00915 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rbp1Q00915 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rbp1Q00915 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rbp1Q00915 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rbp1Q00915 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rbp1Q00915 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rbp1Q00915 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rbp1Q00915 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms