Protein–RNA interactions for Protein: Q00724

Rbp4, Retinol-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp4Q00724 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rbp4Q00724 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rbp4Q00724 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rbp4Q00724 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rbp4Q00724 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rbp4Q00724 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rbp4Q00724 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rbp4Q00724 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rbp4Q00724 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rbp4Q00724 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rbp4Q00724 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rbp4Q00724 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rbp4Q00724 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rbp4Q00724 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rbp4Q00724 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rbp4Q00724 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rbp4Q00724 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Rbp4Q00724 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rbp4Q00724 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rbp4Q00724 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rbp4Q00724 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Rbp4Q00724 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Rbp4Q00724 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rbp4Q00724 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Rbp4Q00724 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rbp4Q00724 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rbp4Q00724 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rbp4Q00724 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rbp4Q00724 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Rbp4Q00724 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Rbp4Q00724 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rbp4Q00724 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Rbp4Q00724 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Rbp4Q00724 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rbp4Q00724 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rbp4Q00724 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rbp4Q00724 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rbp4Q00724 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rbp4Q00724 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rbp4Q00724 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rbp4Q00724 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rbp4Q00724 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rbp4Q00724 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rbp4Q00724 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rbp4Q00724 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rbp4Q00724 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rbp4Q00724 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rbp4Q00724 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rbp4Q00724 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rbp4Q00724 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rbp4Q00724 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rbp4Q00724 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rbp4Q00724 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rbp4Q00724 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rbp4Q00724 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rbp4Q00724 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rbp4Q00724 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rbp4Q00724 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rbp4Q00724 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rbp4Q00724 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rbp4Q00724 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rbp4Q00724 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rbp4Q00724 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rbp4Q00724 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rbp4Q00724 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rbp4Q00724 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rbp4Q00724 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rbp4Q00724 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rbp4Q00724 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rbp4Q00724 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rbp4Q00724 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rbp4Q00724 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Rbp4Q00724 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rbp4Q00724 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rbp4Q00724 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rbp4Q00724 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rbp4Q00724 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rbp4Q00724 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rbp4Q00724 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rbp4Q00724 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rbp4Q00724 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rbp4Q00724 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Rbp4Q00724 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rbp4Q00724 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rbp4Q00724 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rbp4Q00724 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rbp4Q00724 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rbp4Q00724 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rbp4Q00724 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rbp4Q00724 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rbp4Q00724 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Rbp4Q00724 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rbp4Q00724 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rbp4Q00724 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rbp4Q00724 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rbp4Q00724 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rbp4Q00724 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rbp4Q00724 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rbp4Q00724 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rbp4Q00724 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms