Protein–RNA interactions for Protein: Q00558

F8a1, Factor VIII intron 22 protein, mousemouse

Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F8a1Q00558 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
F8a1Q00558 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
F8a1Q00558 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
F8a1Q00558 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
F8a1Q00558 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
F8a1Q00558 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
F8a1Q00558 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
F8a1Q00558 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
F8a1Q00558 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
F8a1Q00558 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
F8a1Q00558 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
F8a1Q00558 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
F8a1Q00558 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
F8a1Q00558 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
F8a1Q00558 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
F8a1Q00558 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
F8a1Q00558 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
F8a1Q00558 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
F8a1Q00558 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
F8a1Q00558 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
F8a1Q00558 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
F8a1Q00558 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
F8a1Q00558 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
F8a1Q00558 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
F8a1Q00558 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
F8a1Q00558 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
F8a1Q00558 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
F8a1Q00558 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
F8a1Q00558 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
F8a1Q00558 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
F8a1Q00558 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
F8a1Q00558 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
F8a1Q00558 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
F8a1Q00558 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
F8a1Q00558 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
F8a1Q00558 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
F8a1Q00558 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
F8a1Q00558 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
F8a1Q00558 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
F8a1Q00558 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
F8a1Q00558 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
F8a1Q00558 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
F8a1Q00558 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
F8a1Q00558 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
F8a1Q00558 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
F8a1Q00558 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
F8a1Q00558 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
F8a1Q00558 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
F8a1Q00558 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
F8a1Q00558 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
F8a1Q00558 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
F8a1Q00558 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
F8a1Q00558 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
F8a1Q00558 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
F8a1Q00558 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
F8a1Q00558 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
F8a1Q00558 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
F8a1Q00558 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
F8a1Q00558 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
F8a1Q00558 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
F8a1Q00558 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
F8a1Q00558 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
F8a1Q00558 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
F8a1Q00558 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
F8a1Q00558 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
F8a1Q00558 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
F8a1Q00558 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
F8a1Q00558 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
F8a1Q00558 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
F8a1Q00558 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
F8a1Q00558 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
F8a1Q00558 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
F8a1Q00558 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
F8a1Q00558 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
F8a1Q00558 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
F8a1Q00558 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
F8a1Q00558 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
F8a1Q00558 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
F8a1Q00558 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
F8a1Q00558 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
F8a1Q00558 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
F8a1Q00558 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
F8a1Q00558 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
F8a1Q00558 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
F8a1Q00558 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
F8a1Q00558 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
F8a1Q00558 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
F8a1Q00558 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
F8a1Q00558 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
F8a1Q00558 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
F8a1Q00558 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
F8a1Q00558 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22■■□□□ 1.11
F8a1Q00558 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
F8a1Q00558 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
F8a1Q00558 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
F8a1Q00558 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
F8a1Q00558 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22■■□□□ 1.11
F8a1Q00558 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
F8a1Q00558 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
F8a1Q00558 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms