Protein–RNA interactions for Protein: Q00547

Hmmr, Hyaluronan mediated motility receptor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 794 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HmmrQ00547 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HmmrQ00547 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HmmrQ00547 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HmmrQ00547 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HmmrQ00547 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HmmrQ00547 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HmmrQ00547 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HmmrQ00547 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HmmrQ00547 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HmmrQ00547 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HmmrQ00547 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HmmrQ00547 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HmmrQ00547 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HmmrQ00547 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HmmrQ00547 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
HmmrQ00547 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
HmmrQ00547 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
HmmrQ00547 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
HmmrQ00547 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HmmrQ00547 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HmmrQ00547 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HmmrQ00547 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HmmrQ00547 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HmmrQ00547 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HmmrQ00547 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HmmrQ00547 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HmmrQ00547 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HmmrQ00547 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HmmrQ00547 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HmmrQ00547 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HmmrQ00547 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HmmrQ00547 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
HmmrQ00547 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HmmrQ00547 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HmmrQ00547 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HmmrQ00547 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HmmrQ00547 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HmmrQ00547 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HmmrQ00547 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HmmrQ00547 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HmmrQ00547 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
HmmrQ00547 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HmmrQ00547 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
HmmrQ00547 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HmmrQ00547 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HmmrQ00547 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HmmrQ00547 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HmmrQ00547 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HmmrQ00547 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HmmrQ00547 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HmmrQ00547 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HmmrQ00547 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
HmmrQ00547 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HmmrQ00547 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HmmrQ00547 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HmmrQ00547 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HmmrQ00547 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HmmrQ00547 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HmmrQ00547 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HmmrQ00547 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HmmrQ00547 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HmmrQ00547 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
HmmrQ00547 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HmmrQ00547 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HmmrQ00547 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HmmrQ00547 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HmmrQ00547 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HmmrQ00547 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HmmrQ00547 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
HmmrQ00547 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HmmrQ00547 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HmmrQ00547 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HmmrQ00547 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HmmrQ00547 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HmmrQ00547 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HmmrQ00547 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HmmrQ00547 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HmmrQ00547 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HmmrQ00547 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HmmrQ00547 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HmmrQ00547 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HmmrQ00547 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HmmrQ00547 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HmmrQ00547 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HmmrQ00547 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
HmmrQ00547 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HmmrQ00547 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HmmrQ00547 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HmmrQ00547 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HmmrQ00547 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HmmrQ00547 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HmmrQ00547 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HmmrQ00547 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HmmrQ00547 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HmmrQ00547 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HmmrQ00547 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HmmrQ00547 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HmmrQ00547 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
HmmrQ00547 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HmmrQ00547 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms