Protein–RNA interactions for Protein: Q00420

Gabpb1, GA-binding protein subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabpb1Q00420 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gabpb1Q00420 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gabpb1Q00420 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gabpb1Q00420 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gabpb1Q00420 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gabpb1Q00420 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Gabpb1Q00420 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gabpb1Q00420 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gabpb1Q00420 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gabpb1Q00420 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gabpb1Q00420 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gabpb1Q00420 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gabpb1Q00420 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gabpb1Q00420 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gabpb1Q00420 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gabpb1Q00420 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gabpb1Q00420 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gabpb1Q00420 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gabpb1Q00420 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gabpb1Q00420 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gabpb1Q00420 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gabpb1Q00420 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gabpb1Q00420 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Gabpb1Q00420 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gabpb1Q00420 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gabpb1Q00420 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gabpb1Q00420 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gabpb1Q00420 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gabpb1Q00420 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gabpb1Q00420 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gabpb1Q00420 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gabpb1Q00420 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gabpb1Q00420 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gabpb1Q00420 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gabpb1Q00420 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Gabpb1Q00420 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gabpb1Q00420 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gabpb1Q00420 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Gabpb1Q00420 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gabpb1Q00420 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gabpb1Q00420 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gabpb1Q00420 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Gabpb1Q00420 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gabpb1Q00420 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gabpb1Q00420 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gabpb1Q00420 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gabpb1Q00420 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Gabpb1Q00420 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gabpb1Q00420 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gabpb1Q00420 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gabpb1Q00420 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gabpb1Q00420 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gabpb1Q00420 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gabpb1Q00420 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gabpb1Q00420 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gabpb1Q00420 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gabpb1Q00420 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gabpb1Q00420 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gabpb1Q00420 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gabpb1Q00420 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gabpb1Q00420 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gabpb1Q00420 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gabpb1Q00420 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Gabpb1Q00420 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gabpb1Q00420 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gabpb1Q00420 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gabpb1Q00420 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gabpb1Q00420 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gabpb1Q00420 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gabpb1Q00420 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gabpb1Q00420 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gabpb1Q00420 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gabpb1Q00420 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gabpb1Q00420 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gabpb1Q00420 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gabpb1Q00420 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Gabpb1Q00420 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gabpb1Q00420 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gabpb1Q00420 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gabpb1Q00420 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gabpb1Q00420 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gabpb1Q00420 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gabpb1Q00420 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gabpb1Q00420 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gabpb1Q00420 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gabpb1Q00420 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gabpb1Q00420 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gabpb1Q00420 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gabpb1Q00420 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gabpb1Q00420 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gabpb1Q00420 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gabpb1Q00420 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gabpb1Q00420 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gabpb1Q00420 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gabpb1Q00420 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Gabpb1Q00420 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gabpb1Q00420 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gabpb1Q00420 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gabpb1Q00420 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Gabpb1Q00420 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms