Protein–RNA interactions for Protein: P97868

Rbbp6, E3 ubiquitin-protein ligase RBBP6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp6P97868 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Rbbp6P97868 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Rbbp6P97868 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Rbbp6P97868 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
Rbbp6P97868 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Rbbp6P97868 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Rbbp6P97868 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Rbbp6P97868 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Rbbp6P97868 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Rbbp6P97868 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Rbbp6P97868 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Rbbp6P97868 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Rbbp6P97868 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Rbbp6P97868 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Rbbp6P97868 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
Rbbp6P97868 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Rbbp6P97868 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Rbbp6P97868 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Rbbp6P97868 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Rbbp6P97868 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Rbbp6P97868 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Rbbp6P97868 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Rbbp6P97868 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
Rbbp6P97868 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Rbbp6P97868 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Rbbp6P97868 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Rbbp6P97868 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Rbbp6P97868 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Rbbp6P97868 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Rbbp6P97868 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Rbbp6P97868 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Rbbp6P97868 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Rbbp6P97868 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Rbbp6P97868 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Rbbp6P97868 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Rbbp6P97868 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Rbbp6P97868 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Rbbp6P97868 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Rbbp6P97868 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Rbbp6P97868 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Rbbp6P97868 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Rbbp6P97868 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Rbbp6P97868 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Rbbp6P97868 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Rbbp6P97868 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Rbbp6P97868 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Rbbp6P97868 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Rbbp6P97868 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Rbbp6P97868 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Rbbp6P97868 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Rbbp6P97868 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Rbbp6P97868 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
Rbbp6P97868 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Rbbp6P97868 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Rbbp6P97868 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Rbbp6P97868 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Rbbp6P97868 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Rbbp6P97868 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC27.14■■□□□ 1.93
Rbbp6P97868 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC27.14■■□□□ 1.93
Rbbp6P97868 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Rbbp6P97868 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Rbbp6P97868 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Rbbp6P97868 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Rbbp6P97868 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Rbbp6P97868 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Rbbp6P97868 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Rbbp6P97868 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Rbbp6P97868 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Rbbp6P97868 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Rbbp6P97868 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Rbbp6P97868 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Rbbp6P97868 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Rbbp6P97868 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Rbbp6P97868 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Rbbp6P97868 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Rbbp6P97868 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Rbbp6P97868 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Rbbp6P97868 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Rbbp6P97868 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Rbbp6P97868 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Rbbp6P97868 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Rbbp6P97868 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Rbbp6P97868 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Rbbp6P97868 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Rbbp6P97868 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Rbbp6P97868 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Rbbp6P97868 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Rbbp6P97868 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Rbbp6P97868 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Rbbp6P97868 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Rbbp6P97868 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Rbbp6P97868 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Rbbp6P97868 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Rbbp6P97868 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Rbbp6P97868 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Rbbp6P97868 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Rbbp6P97868 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
Rbbp6P97868 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Rbbp6P97868 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Rbbp6P97868 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms