Protein–RNA interactions for Protein: P97473

Tarbp2, RISC-loading complex subunit TARBP2, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tarbp2P97473 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tarbp2P97473 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tarbp2P97473 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tarbp2P97473 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tarbp2P97473 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tarbp2P97473 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tarbp2P97473 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tarbp2P97473 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tarbp2P97473 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tarbp2P97473 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tarbp2P97473 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tarbp2P97473 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tarbp2P97473 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tarbp2P97473 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tarbp2P97473 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tarbp2P97473 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tarbp2P97473 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tarbp2P97473 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tarbp2P97473 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tarbp2P97473 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tarbp2P97473 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tarbp2P97473 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Tarbp2P97473 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Tarbp2P97473 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Tarbp2P97473 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tarbp2P97473 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tarbp2P97473 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tarbp2P97473 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tarbp2P97473 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Tarbp2P97473 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Tarbp2P97473 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tarbp2P97473 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tarbp2P97473 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tarbp2P97473 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tarbp2P97473 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Tarbp2P97473 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Tarbp2P97473 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tarbp2P97473 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tarbp2P97473 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Tarbp2P97473 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Tarbp2P97473 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tarbp2P97473 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Tarbp2P97473 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tarbp2P97473 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tarbp2P97473 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tarbp2P97473 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tarbp2P97473 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tarbp2P97473 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tarbp2P97473 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tarbp2P97473 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tarbp2P97473 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Tarbp2P97473 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tarbp2P97473 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tarbp2P97473 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Tarbp2P97473 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tarbp2P97473 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tarbp2P97473 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tarbp2P97473 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tarbp2P97473 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tarbp2P97473 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tarbp2P97473 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tarbp2P97473 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tarbp2P97473 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tarbp2P97473 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tarbp2P97473 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tarbp2P97473 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tarbp2P97473 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tarbp2P97473 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tarbp2P97473 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tarbp2P97473 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Tarbp2P97473 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tarbp2P97473 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tarbp2P97473 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tarbp2P97473 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tarbp2P97473 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tarbp2P97473 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tarbp2P97473 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tarbp2P97473 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tarbp2P97473 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tarbp2P97473 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tarbp2P97473 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tarbp2P97473 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tarbp2P97473 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tarbp2P97473 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tarbp2P97473 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tarbp2P97473 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Tarbp2P97473 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
Tarbp2P97473 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Tarbp2P97473 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tarbp2P97473 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tarbp2P97473 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tarbp2P97473 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tarbp2P97473 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tarbp2P97473 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tarbp2P97473 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tarbp2P97473 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tarbp2P97473 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tarbp2P97473 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tarbp2P97473 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tarbp2P97473 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.3 ms