Protein–RNA interactions for Protein: P97350

Pkp1, Plakophilin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp1P97350 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Pkp1P97350 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Pkp1P97350 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Pkp1P97350 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
Pkp1P97350 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Pkp1P97350 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Pkp1P97350 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Pkp1P97350 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Pkp1P97350 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Pkp1P97350 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Pkp1P97350 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Pkp1P97350 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Pkp1P97350 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Pkp1P97350 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Pkp1P97350 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Pkp1P97350 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Pkp1P97350 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Pkp1P97350 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Pkp1P97350 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Pkp1P97350 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Pkp1P97350 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Pkp1P97350 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Pkp1P97350 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Pkp1P97350 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Pkp1P97350 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Pkp1P97350 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Pkp1P97350 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Pkp1P97350 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Pkp1P97350 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Pkp1P97350 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Pkp1P97350 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Pkp1P97350 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Pkp1P97350 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Pkp1P97350 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Pkp1P97350 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Pkp1P97350 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Pkp1P97350 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Pkp1P97350 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Pkp1P97350 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Pkp1P97350 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Pkp1P97350 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Pkp1P97350 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Pkp1P97350 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Pkp1P97350 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Pkp1P97350 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Pkp1P97350 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Pkp1P97350 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Pkp1P97350 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Pkp1P97350 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Pkp1P97350 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Pkp1P97350 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Pkp1P97350 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Pkp1P97350 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Pkp1P97350 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Pkp1P97350 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Pkp1P97350 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Pkp1P97350 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Pkp1P97350 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Pkp1P97350 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Pkp1P97350 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Pkp1P97350 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Pkp1P97350 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
Pkp1P97350 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Pkp1P97350 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Pkp1P97350 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Pkp1P97350 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Pkp1P97350 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Pkp1P97350 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Pkp1P97350 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Pkp1P97350 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Pkp1P97350 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Pkp1P97350 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Pkp1P97350 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Pkp1P97350 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Pkp1P97350 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Pkp1P97350 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Pkp1P97350 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Pkp1P97350 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Pkp1P97350 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Pkp1P97350 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Pkp1P97350 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Pkp1P97350 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Pkp1P97350 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Pkp1P97350 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Pkp1P97350 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Pkp1P97350 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Pkp1P97350 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Pkp1P97350 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
Pkp1P97350 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Pkp1P97350 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Pkp1P97350 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Pkp1P97350 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Pkp1P97350 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Pkp1P97350 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Pkp1P97350 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Pkp1P97350 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Pkp1P97350 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Pkp1P97350 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Pkp1P97350 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Pkp1P97350 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.1 ms