Protein–RNA interactions for Protein: P97334

Nkx2-3, Homeobox protein Nkx-2.3, mousemouse

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx2-3P97334 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Nkx2-3P97334 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Nkx2-3P97334 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Nkx2-3P97334 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Nkx2-3P97334 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Nkx2-3P97334 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Nkx2-3P97334 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Nkx2-3P97334 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Nkx2-3P97334 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
Nkx2-3P97334 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Nkx2-3P97334 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Nkx2-3P97334 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Nkx2-3P97334 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Nkx2-3P97334 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Nkx2-3P97334 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
Nkx2-3P97334 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Nkx2-3P97334 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Nkx2-3P97334 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Nkx2-3P97334 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Nkx2-3P97334 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Nkx2-3P97334 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Nkx2-3P97334 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Nkx2-3P97334 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Nkx2-3P97334 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Nkx2-3P97334 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Nkx2-3P97334 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Nkx2-3P97334 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Nkx2-3P97334 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Nkx2-3P97334 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Nkx2-3P97334 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Nkx2-3P97334 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Nkx2-3P97334 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Nkx2-3P97334 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Nkx2-3P97334 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Nkx2-3P97334 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Nkx2-3P97334 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Nkx2-3P97334 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Nkx2-3P97334 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Nkx2-3P97334 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Nkx2-3P97334 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Nkx2-3P97334 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Nkx2-3P97334 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Nkx2-3P97334 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Nkx2-3P97334 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Nkx2-3P97334 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Nkx2-3P97334 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
Nkx2-3P97334 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Nkx2-3P97334 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Nkx2-3P97334 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Nkx2-3P97334 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Nkx2-3P97334 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Nkx2-3P97334 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Nkx2-3P97334 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Nkx2-3P97334 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Nkx2-3P97334 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Nkx2-3P97334 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Nkx2-3P97334 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Nkx2-3P97334 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
Nkx2-3P97334 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
Nkx2-3P97334 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
Nkx2-3P97334 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Nkx2-3P97334 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Nkx2-3P97334 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Nkx2-3P97334 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
Nkx2-3P97334 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Nkx2-3P97334 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Nkx2-3P97334 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Nkx2-3P97334 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Nkx2-3P97334 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Nkx2-3P97334 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Nkx2-3P97334 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
Nkx2-3P97334 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
Nkx2-3P97334 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Nkx2-3P97334 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Nkx2-3P97334 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Nkx2-3P97334 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
Nkx2-3P97334 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Nkx2-3P97334 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
Nkx2-3P97334 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Nkx2-3P97334 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Nkx2-3P97334 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Nkx2-3P97334 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Nkx2-3P97334 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Nkx2-3P97334 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Nkx2-3P97334 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Nkx2-3P97334 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Nkx2-3P97334 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Nkx2-3P97334 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
Nkx2-3P97334 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Nkx2-3P97334 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Nkx2-3P97334 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Nkx2-3P97334 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Nkx2-3P97334 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Nkx2-3P97334 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Nkx2-3P97334 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Nkx2-3P97334 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Nkx2-3P97334 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Nkx2-3P97334 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Nkx2-3P97334 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Nkx2-3P97334 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 187.3 ms