Protein–RNA interactions for Protein: P83503

Nyx, Nyctalopin, mousemouse

Predictions only

Length 476 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NyxP83503 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
NyxP83503 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
NyxP83503 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
NyxP83503 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NyxP83503 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NyxP83503 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
NyxP83503 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NyxP83503 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
NyxP83503 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
NyxP83503 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
NyxP83503 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
NyxP83503 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
NyxP83503 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
NyxP83503 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
NyxP83503 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
NyxP83503 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NyxP83503 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
NyxP83503 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
NyxP83503 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
NyxP83503 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
NyxP83503 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
NyxP83503 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
NyxP83503 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
NyxP83503 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NyxP83503 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NyxP83503 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NyxP83503 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NyxP83503 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NyxP83503 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NyxP83503 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NyxP83503 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
NyxP83503 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NyxP83503 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NyxP83503 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NyxP83503 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NyxP83503 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NyxP83503 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NyxP83503 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NyxP83503 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NyxP83503 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NyxP83503 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NyxP83503 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NyxP83503 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NyxP83503 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NyxP83503 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
NyxP83503 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NyxP83503 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NyxP83503 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NyxP83503 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NyxP83503 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NyxP83503 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NyxP83503 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NyxP83503 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NyxP83503 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NyxP83503 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NyxP83503 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NyxP83503 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
NyxP83503 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
NyxP83503 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
NyxP83503 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
NyxP83503 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NyxP83503 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
NyxP83503 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NyxP83503 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
NyxP83503 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NyxP83503 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NyxP83503 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
NyxP83503 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NyxP83503 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NyxP83503 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NyxP83503 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NyxP83503 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NyxP83503 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
NyxP83503 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NyxP83503 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NyxP83503 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NyxP83503 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NyxP83503 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NyxP83503 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
NyxP83503 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
NyxP83503 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
NyxP83503 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
NyxP83503 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NyxP83503 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NyxP83503 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
NyxP83503 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NyxP83503 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NyxP83503 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NyxP83503 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NyxP83503 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NyxP83503 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NyxP83503 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NyxP83503 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NyxP83503 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
NyxP83503 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NyxP83503 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NyxP83503 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NyxP83503 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
NyxP83503 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NyxP83503 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms