Protein–RNA interactions for Protein: P82976

Gbx1, Homeobox protein GBX-1, mousemouse

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbx1P82976 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gbx1P82976 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gbx1P82976 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gbx1P82976 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gbx1P82976 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gbx1P82976 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gbx1P82976 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gbx1P82976 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gbx1P82976 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gbx1P82976 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gbx1P82976 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gbx1P82976 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gbx1P82976 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gbx1P82976 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gbx1P82976 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gbx1P82976 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gbx1P82976 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gbx1P82976 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gbx1P82976 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gbx1P82976 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gbx1P82976 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gbx1P82976 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gbx1P82976 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gbx1P82976 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gbx1P82976 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gbx1P82976 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gbx1P82976 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gbx1P82976 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gbx1P82976 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gbx1P82976 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gbx1P82976 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gbx1P82976 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gbx1P82976 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gbx1P82976 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gbx1P82976 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gbx1P82976 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gbx1P82976 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gbx1P82976 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gbx1P82976 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gbx1P82976 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gbx1P82976 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gbx1P82976 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gbx1P82976 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gbx1P82976 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gbx1P82976 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gbx1P82976 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gbx1P82976 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gbx1P82976 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gbx1P82976 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gbx1P82976 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gbx1P82976 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gbx1P82976 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gbx1P82976 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gbx1P82976 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gbx1P82976 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gbx1P82976 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gbx1P82976 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gbx1P82976 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gbx1P82976 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gbx1P82976 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gbx1P82976 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Gbx1P82976 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gbx1P82976 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Gbx1P82976 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gbx1P82976 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gbx1P82976 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gbx1P82976 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gbx1P82976 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gbx1P82976 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gbx1P82976 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gbx1P82976 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Gbx1P82976 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gbx1P82976 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gbx1P82976 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gbx1P82976 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gbx1P82976 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gbx1P82976 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gbx1P82976 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gbx1P82976 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gbx1P82976 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gbx1P82976 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gbx1P82976 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Gbx1P82976 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gbx1P82976 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gbx1P82976 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gbx1P82976 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gbx1P82976 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gbx1P82976 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gbx1P82976 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Gbx1P82976 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gbx1P82976 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gbx1P82976 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gbx1P82976 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gbx1P82976 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gbx1P82976 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gbx1P82976 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gbx1P82976 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gbx1P82976 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gbx1P82976 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gbx1P82976 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms