Protein–RNA interactions for Protein: P70671

Irf3, Interferon regulatory factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf3P70671 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Irf3P70671 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Irf3P70671 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Irf3P70671 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Irf3P70671 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Irf3P70671 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Irf3P70671 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Irf3P70671 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Irf3P70671 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Irf3P70671 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Irf3P70671 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Irf3P70671 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Irf3P70671 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Irf3P70671 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Irf3P70671 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Irf3P70671 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Irf3P70671 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Irf3P70671 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Irf3P70671 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Irf3P70671 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Irf3P70671 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Irf3P70671 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Irf3P70671 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Irf3P70671 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Irf3P70671 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Irf3P70671 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Irf3P70671 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Irf3P70671 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Irf3P70671 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Irf3P70671 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Irf3P70671 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Irf3P70671 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Irf3P70671 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Irf3P70671 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Irf3P70671 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Irf3P70671 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Irf3P70671 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Irf3P70671 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Irf3P70671 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Irf3P70671 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Irf3P70671 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Irf3P70671 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Irf3P70671 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Irf3P70671 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Irf3P70671 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Irf3P70671 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Irf3P70671 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Irf3P70671 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Irf3P70671 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Irf3P70671 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Irf3P70671 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Irf3P70671 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Irf3P70671 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Irf3P70671 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Irf3P70671 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Irf3P70671 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Irf3P70671 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Irf3P70671 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Irf3P70671 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Irf3P70671 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Irf3P70671 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Irf3P70671 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Irf3P70671 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Irf3P70671 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Irf3P70671 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Irf3P70671 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Irf3P70671 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Irf3P70671 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Irf3P70671 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Irf3P70671 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Irf3P70671 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Irf3P70671 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Irf3P70671 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Irf3P70671 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Irf3P70671 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Irf3P70671 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Irf3P70671 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Irf3P70671 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Irf3P70671 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Irf3P70671 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Irf3P70671 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Irf3P70671 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Irf3P70671 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Irf3P70671 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Irf3P70671 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Irf3P70671 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Irf3P70671 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Irf3P70671 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Irf3P70671 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Irf3P70671 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Irf3P70671 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Irf3P70671 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Irf3P70671 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Irf3P70671 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Irf3P70671 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Irf3P70671 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Irf3P70671 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Irf3P70671 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Irf3P70671 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Irf3P70671 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms