Protein–RNA interactions for Protein: P70338

Gfi1, Zinc finger protein Gfi-1, mousemouse

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfi1P70338 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gfi1P70338 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gfi1P70338 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gfi1P70338 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gfi1P70338 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gfi1P70338 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gfi1P70338 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Gfi1P70338 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gfi1P70338 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Gfi1P70338 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gfi1P70338 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Gfi1P70338 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gfi1P70338 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gfi1P70338 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gfi1P70338 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gfi1P70338 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gfi1P70338 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gfi1P70338 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Gfi1P70338 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gfi1P70338 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gfi1P70338 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gfi1P70338 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gfi1P70338 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gfi1P70338 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gfi1P70338 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gfi1P70338 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Gfi1P70338 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Gfi1P70338 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Gfi1P70338 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gfi1P70338 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gfi1P70338 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gfi1P70338 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gfi1P70338 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gfi1P70338 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gfi1P70338 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gfi1P70338 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gfi1P70338 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gfi1P70338 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gfi1P70338 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gfi1P70338 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gfi1P70338 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gfi1P70338 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gfi1P70338 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gfi1P70338 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gfi1P70338 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gfi1P70338 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gfi1P70338 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gfi1P70338 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gfi1P70338 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gfi1P70338 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gfi1P70338 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gfi1P70338 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gfi1P70338 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Gfi1P70338 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gfi1P70338 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gfi1P70338 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gfi1P70338 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gfi1P70338 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gfi1P70338 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gfi1P70338 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gfi1P70338 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Gfi1P70338 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gfi1P70338 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Gfi1P70338 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gfi1P70338 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Gfi1P70338 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gfi1P70338 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Gfi1P70338 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Gfi1P70338 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Gfi1P70338 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gfi1P70338 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gfi1P70338 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Gfi1P70338 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Gfi1P70338 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Gfi1P70338 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gfi1P70338 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gfi1P70338 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gfi1P70338 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gfi1P70338 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gfi1P70338 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Gfi1P70338 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Gfi1P70338 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gfi1P70338 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gfi1P70338 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Gfi1P70338 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Gfi1P70338 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gfi1P70338 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Gfi1P70338 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gfi1P70338 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gfi1P70338 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gfi1P70338 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gfi1P70338 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gfi1P70338 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gfi1P70338 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gfi1P70338 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gfi1P70338 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gfi1P70338 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gfi1P70338 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Gfi1P70338 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gfi1P70338 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms