Protein–RNA interactions for Protein: P70284

Tgif1, Homeobox protein TGIF1, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgif1P70284 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Tgif1P70284 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Tgif1P70284 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tgif1P70284 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tgif1P70284 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tgif1P70284 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tgif1P70284 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tgif1P70284 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tgif1P70284 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tgif1P70284 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tgif1P70284 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tgif1P70284 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Tgif1P70284 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tgif1P70284 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tgif1P70284 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tgif1P70284 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tgif1P70284 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Tgif1P70284 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tgif1P70284 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tgif1P70284 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tgif1P70284 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tgif1P70284 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Tgif1P70284 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Tgif1P70284 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tgif1P70284 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tgif1P70284 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tgif1P70284 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tgif1P70284 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tgif1P70284 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tgif1P70284 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tgif1P70284 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tgif1P70284 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tgif1P70284 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Tgif1P70284 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tgif1P70284 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tgif1P70284 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tgif1P70284 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tgif1P70284 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tgif1P70284 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tgif1P70284 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tgif1P70284 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tgif1P70284 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tgif1P70284 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tgif1P70284 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tgif1P70284 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tgif1P70284 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tgif1P70284 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tgif1P70284 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tgif1P70284 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tgif1P70284 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tgif1P70284 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tgif1P70284 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tgif1P70284 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Tgif1P70284 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Tgif1P70284 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Tgif1P70284 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tgif1P70284 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tgif1P70284 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tgif1P70284 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tgif1P70284 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tgif1P70284 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tgif1P70284 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tgif1P70284 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tgif1P70284 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Tgif1P70284 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tgif1P70284 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tgif1P70284 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tgif1P70284 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
Tgif1P70284 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tgif1P70284 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tgif1P70284 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tgif1P70284 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tgif1P70284 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tgif1P70284 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tgif1P70284 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tgif1P70284 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tgif1P70284 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tgif1P70284 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tgif1P70284 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tgif1P70284 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tgif1P70284 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tgif1P70284 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tgif1P70284 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tgif1P70284 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tgif1P70284 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tgif1P70284 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tgif1P70284 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tgif1P70284 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tgif1P70284 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tgif1P70284 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tgif1P70284 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tgif1P70284 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tgif1P70284 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tgif1P70284 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Tgif1P70284 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tgif1P70284 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tgif1P70284 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tgif1P70284 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tgif1P70284 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tgif1P70284 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms