Protein–RNA interactions for Protein: P70257

Nfix, Nuclear factor 1 X-type, mousemouse

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Length 488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfixP70257 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NfixP70257 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NfixP70257 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC27.53■■■□□ 2
NfixP70257 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
NfixP70257 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC27.53■■■□□ 2
NfixP70257 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
NfixP70257 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
NfixP70257 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
NfixP70257 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NfixP70257 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NfixP70257 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NfixP70257 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NfixP70257 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NfixP70257 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
NfixP70257 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
NfixP70257 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NfixP70257 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NfixP70257 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
NfixP70257 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
NfixP70257 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NfixP70257 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NfixP70257 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
NfixP70257 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
NfixP70257 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
NfixP70257 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NfixP70257 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NfixP70257 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NfixP70257 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
NfixP70257 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
NfixP70257 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NfixP70257 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NfixP70257 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NfixP70257 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NfixP70257 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
NfixP70257 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
NfixP70257 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
NfixP70257 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NfixP70257 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NfixP70257 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NfixP70257 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NfixP70257 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NfixP70257 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NfixP70257 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NfixP70257 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NfixP70257 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NfixP70257 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NfixP70257 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NfixP70257 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NfixP70257 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NfixP70257 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NfixP70257 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NfixP70257 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
NfixP70257 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NfixP70257 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
NfixP70257 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
NfixP70257 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
NfixP70257 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NfixP70257 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NfixP70257 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
NfixP70257 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NfixP70257 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NfixP70257 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NfixP70257 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
NfixP70257 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
NfixP70257 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
NfixP70257 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NfixP70257 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
NfixP70257 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
NfixP70257 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
NfixP70257 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
NfixP70257 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
NfixP70257 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NfixP70257 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NfixP70257 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NfixP70257 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NfixP70257 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NfixP70257 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NfixP70257 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NfixP70257 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
NfixP70257 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NfixP70257 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
NfixP70257 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NfixP70257 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
NfixP70257 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
NfixP70257 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NfixP70257 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
NfixP70257 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NfixP70257 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
NfixP70257 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NfixP70257 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
NfixP70257 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NfixP70257 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NfixP70257 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NfixP70257 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
NfixP70257 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
NfixP70257 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NfixP70257 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NfixP70257 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NfixP70257 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NfixP70257 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.6 ms