Protein–RNA interactions for Protein: P70217

Hoxd13, Homeobox protein Hox-D13, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd13P70217 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Hoxd13P70217 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Hoxd13P70217 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Hoxd13P70217 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Hoxd13P70217 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Hoxd13P70217 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Hoxd13P70217 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Hoxd13P70217 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Hoxd13P70217 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Hoxd13P70217 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Hoxd13P70217 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Hoxd13P70217 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Hoxd13P70217 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Hoxd13P70217 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Hoxd13P70217 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Hoxd13P70217 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Hoxd13P70217 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Hoxd13P70217 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Hoxd13P70217 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Hoxd13P70217 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Hoxd13P70217 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Hoxd13P70217 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Hoxd13P70217 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Hoxd13P70217 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Hoxd13P70217 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Hoxd13P70217 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Hoxd13P70217 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Hoxd13P70217 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Hoxd13P70217 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Hoxd13P70217 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Hoxd13P70217 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Hoxd13P70217 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Hoxd13P70217 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Hoxd13P70217 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Hoxd13P70217 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Hoxd13P70217 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Hoxd13P70217 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Hoxd13P70217 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Hoxd13P70217 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Hoxd13P70217 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Hoxd13P70217 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Hoxd13P70217 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Hoxd13P70217 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Hoxd13P70217 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Hoxd13P70217 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Hoxd13P70217 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Hoxd13P70217 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Hoxd13P70217 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Hoxd13P70217 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Hoxd13P70217 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Hoxd13P70217 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Hoxd13P70217 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Hoxd13P70217 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Hoxd13P70217 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Hoxd13P70217 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Hoxd13P70217 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Hoxd13P70217 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Hoxd13P70217 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Hoxd13P70217 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Hoxd13P70217 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Hoxd13P70217 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Hoxd13P70217 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Hoxd13P70217 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Hoxd13P70217 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Hoxd13P70217 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Hoxd13P70217 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Hoxd13P70217 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Hoxd13P70217 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Hoxd13P70217 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Hoxd13P70217 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Hoxd13P70217 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Hoxd13P70217 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Hoxd13P70217 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Hoxd13P70217 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Hoxd13P70217 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Hoxd13P70217 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Hoxd13P70217 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Hoxd13P70217 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Hoxd13P70217 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Hoxd13P70217 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Hoxd13P70217 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Hoxd13P70217 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Hoxd13P70217 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Hoxd13P70217 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Hoxd13P70217 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Hoxd13P70217 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Hoxd13P70217 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Hoxd13P70217 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Hoxd13P70217 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Hoxd13P70217 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Hoxd13P70217 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Hoxd13P70217 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Hoxd13P70217 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Hoxd13P70217 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Hoxd13P70217 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Hoxd13P70217 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Hoxd13P70217 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Hoxd13P70217 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Hoxd13P70217 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Hoxd13P70217 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms