Protein–RNA interactions for Protein: P70196

Traf6, TNF receptor-associated factor 6, mousemouse

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf6P70196 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Traf6P70196 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Traf6P70196 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Traf6P70196 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Traf6P70196 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Traf6P70196 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Traf6P70196 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Traf6P70196 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Traf6P70196 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Traf6P70196 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Traf6P70196 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Traf6P70196 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Traf6P70196 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Traf6P70196 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Traf6P70196 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Traf6P70196 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Traf6P70196 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Traf6P70196 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Traf6P70196 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Traf6P70196 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Traf6P70196 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Traf6P70196 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Traf6P70196 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Traf6P70196 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Traf6P70196 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Traf6P70196 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Traf6P70196 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Traf6P70196 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Traf6P70196 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Traf6P70196 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Traf6P70196 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Traf6P70196 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Traf6P70196 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Traf6P70196 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Traf6P70196 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Traf6P70196 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Traf6P70196 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Traf6P70196 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Traf6P70196 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Traf6P70196 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Traf6P70196 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Traf6P70196 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Traf6P70196 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Traf6P70196 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Traf6P70196 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Traf6P70196 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Traf6P70196 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Traf6P70196 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Traf6P70196 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Traf6P70196 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Traf6P70196 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Traf6P70196 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Traf6P70196 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Traf6P70196 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Traf6P70196 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Traf6P70196 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Traf6P70196 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Traf6P70196 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Traf6P70196 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Traf6P70196 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Traf6P70196 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Traf6P70196 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Traf6P70196 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
Traf6P70196 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Traf6P70196 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Traf6P70196 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Traf6P70196 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Traf6P70196 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Traf6P70196 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Traf6P70196 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Traf6P70196 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Traf6P70196 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Traf6P70196 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Traf6P70196 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Traf6P70196 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Traf6P70196 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Traf6P70196 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Traf6P70196 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Traf6P70196 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Traf6P70196 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Traf6P70196 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Traf6P70196 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Traf6P70196 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Traf6P70196 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Traf6P70196 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Traf6P70196 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Traf6P70196 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Traf6P70196 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Traf6P70196 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Traf6P70196 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Traf6P70196 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Traf6P70196 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Traf6P70196 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Traf6P70196 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Traf6P70196 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Traf6P70196 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Traf6P70196 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Traf6P70196 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Traf6P70196 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Traf6P70196 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.8 ms