Protein–RNA interactions for Protein: P70191

Traf5, TNF receptor-associated factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf5P70191 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
Traf5P70191 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Traf5P70191 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Traf5P70191 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Traf5P70191 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Traf5P70191 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Traf5P70191 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Traf5P70191 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Traf5P70191 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Traf5P70191 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Traf5P70191 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
Traf5P70191 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Traf5P70191 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
Traf5P70191 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Traf5P70191 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Traf5P70191 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Traf5P70191 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Traf5P70191 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Traf5P70191 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Traf5P70191 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Traf5P70191 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Traf5P70191 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Traf5P70191 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Traf5P70191 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Traf5P70191 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Traf5P70191 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Traf5P70191 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Traf5P70191 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Traf5P70191 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Traf5P70191 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Traf5P70191 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Traf5P70191 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Traf5P70191 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Traf5P70191 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Traf5P70191 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Traf5P70191 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Traf5P70191 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Traf5P70191 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Traf5P70191 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Traf5P70191 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Traf5P70191 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Traf5P70191 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Traf5P70191 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Traf5P70191 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Traf5P70191 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Traf5P70191 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Traf5P70191 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Traf5P70191 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Traf5P70191 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Traf5P70191 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Traf5P70191 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Traf5P70191 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Traf5P70191 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Traf5P70191 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Traf5P70191 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Traf5P70191 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Traf5P70191 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Traf5P70191 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Traf5P70191 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Traf5P70191 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Traf5P70191 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Traf5P70191 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Traf5P70191 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Traf5P70191 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Traf5P70191 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Traf5P70191 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Traf5P70191 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Traf5P70191 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Traf5P70191 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Traf5P70191 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Traf5P70191 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Traf5P70191 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Traf5P70191 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Traf5P70191 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Traf5P70191 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Traf5P70191 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Traf5P70191 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Traf5P70191 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Traf5P70191 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Traf5P70191 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Traf5P70191 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Traf5P70191 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Traf5P70191 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Traf5P70191 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Traf5P70191 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Traf5P70191 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Traf5P70191 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Traf5P70191 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Traf5P70191 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Traf5P70191 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Traf5P70191 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Traf5P70191 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Traf5P70191 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Traf5P70191 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Traf5P70191 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Traf5P70191 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Traf5P70191 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Traf5P70191 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Traf5P70191 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Traf5P70191 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms