Protein–RNA interactions for Protein: P62242

Rps8, 40S ribosomal protein S8, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 208 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps8P62242 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Rps8P62242 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Rps8P62242 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Rps8P62242 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Rps8P62242 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Rps8P62242 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Rps8P62242 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Rps8P62242 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Rps8P62242 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Rps8P62242 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Rps8P62242 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Rps8P62242 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Rps8P62242 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Rps8P62242 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Rps8P62242 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Rps8P62242 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Rps8P62242 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Rps8P62242 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
Rps8P62242 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Rps8P62242 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
Rps8P62242 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Rps8P62242 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Rps8P62242 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
Rps8P62242 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
Rps8P62242 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC27.54■■■□□ 2
Rps8P62242 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Rps8P62242 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Rps8P62242 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Rps8P62242 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Rps8P62242 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
Rps8P62242 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Rps8P62242 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Rps8P62242 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Rps8P62242 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
Rps8P62242 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Rps8P62242 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Rps8P62242 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Rps8P62242 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Rps8P62242 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Rps8P62242 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Rps8P62242 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Rps8P62242 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Rps8P62242 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Rps8P62242 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Rps8P62242 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Rps8P62242 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Rps8P62242 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Rps8P62242 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Rps8P62242 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Rps8P62242 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Rps8P62242 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Rps8P62242 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Rps8P62242 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Rps8P62242 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Rps8P62242 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Rps8P62242 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Rps8P62242 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Rps8P62242 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Rps8P62242 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
Rps8P62242 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Rps8P62242 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
Rps8P62242 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Rps8P62242 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Rps8P62242 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Rps8P62242 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Rps8P62242 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Rps8P62242 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Rps8P62242 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Rps8P62242 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Rps8P62242 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Rps8P62242 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Rps8P62242 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Rps8P62242 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Rps8P62242 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Rps8P62242 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Rps8P62242 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Rps8P62242 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Rps8P62242 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Rps8P62242 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Rps8P62242 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Rps8P62242 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
Rps8P62242 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Rps8P62242 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Rps8P62242 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Rps8P62242 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
Rps8P62242 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Rps8P62242 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Rps8P62242 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Rps8P62242 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Rps8P62242 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Rps8P62242 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Rps8P62242 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Rps8P62242 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Rps8P62242 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Rps8P62242 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Rps8P62242 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Rps8P62242 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Rps8P62242 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
Rps8P62242 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Rps8P62242 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms