Protein–RNA interactions for Protein: P61750

Arf4, ADP-ribosylation factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arf4P61750 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Arf4P61750 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Arf4P61750 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Arf4P61750 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Arf4P61750 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Arf4P61750 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Arf4P61750 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Arf4P61750 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Arf4P61750 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Arf4P61750 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Arf4P61750 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Arf4P61750 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Arf4P61750 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Arf4P61750 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Arf4P61750 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Arf4P61750 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Arf4P61750 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Arf4P61750 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Arf4P61750 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Arf4P61750 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Arf4P61750 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Arf4P61750 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Arf4P61750 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Arf4P61750 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Arf4P61750 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Arf4P61750 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Arf4P61750 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Arf4P61750 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Arf4P61750 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Arf4P61750 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Arf4P61750 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Arf4P61750 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Arf4P61750 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Arf4P61750 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Arf4P61750 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Arf4P61750 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Arf4P61750 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Arf4P61750 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Arf4P61750 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Arf4P61750 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Arf4P61750 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Arf4P61750 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Arf4P61750 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Arf4P61750 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Arf4P61750 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Arf4P61750 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Arf4P61750 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Arf4P61750 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Arf4P61750 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Arf4P61750 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Arf4P61750 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Arf4P61750 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Arf4P61750 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Arf4P61750 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Arf4P61750 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Arf4P61750 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Arf4P61750 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Arf4P61750 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Arf4P61750 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Arf4P61750 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Arf4P61750 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Arf4P61750 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Arf4P61750 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Arf4P61750 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Arf4P61750 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Arf4P61750 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Arf4P61750 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Arf4P61750 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Arf4P61750 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Arf4P61750 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Arf4P61750 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Arf4P61750 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Arf4P61750 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Arf4P61750 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Arf4P61750 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Arf4P61750 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Arf4P61750 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Arf4P61750 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Arf4P61750 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Arf4P61750 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Arf4P61750 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Arf4P61750 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Arf4P61750 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Arf4P61750 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Arf4P61750 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Arf4P61750 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Arf4P61750 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Arf4P61750 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Arf4P61750 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Arf4P61750 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Arf4P61750 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Arf4P61750 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Arf4P61750 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Arf4P61750 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Arf4P61750 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Arf4P61750 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Arf4P61750 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Arf4P61750 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Arf4P61750 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Arf4P61750 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.1 ms