Protein–RNA interactions for Protein: P61148

Fgf1, Fibroblast growth factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 155 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgf1P61148 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fgf1P61148 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Fgf1P61148 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Fgf1P61148 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Fgf1P61148 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Fgf1P61148 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fgf1P61148 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fgf1P61148 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Fgf1P61148 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fgf1P61148 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Fgf1P61148 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fgf1P61148 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fgf1P61148 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Fgf1P61148 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC21.28■■□□□ 1
Fgf1P61148 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Fgf1P61148 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Fgf1P61148 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Fgf1P61148 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Fgf1P61148 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Fgf1P61148 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Fgf1P61148 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Fgf1P61148 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Fgf1P61148 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Fgf1P61148 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fgf1P61148 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fgf1P61148 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fgf1P61148 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fgf1P61148 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fgf1P61148 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fgf1P61148 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fgf1P61148 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Fgf1P61148 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fgf1P61148 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fgf1P61148 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fgf1P61148 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fgf1P61148 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fgf1P61148 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fgf1P61148 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fgf1P61148 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Fgf1P61148 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Fgf1P61148 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fgf1P61148 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Fgf1P61148 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Fgf1P61148 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Fgf1P61148 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Fgf1P61148 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Fgf1P61148 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Fgf1P61148 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Fgf1P61148 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Fgf1P61148 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Fgf1P61148 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Fgf1P61148 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Fgf1P61148 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Fgf1P61148 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Fgf1P61148 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Fgf1P61148 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Fgf1P61148 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Fgf1P61148 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Fgf1P61148 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Fgf1P61148 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Fgf1P61148 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Fgf1P61148 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Fgf1P61148 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Fgf1P61148 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Fgf1P61148 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Fgf1P61148 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Fgf1P61148 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Fgf1P61148 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Fgf1P61148 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Fgf1P61148 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Fgf1P61148 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Fgf1P61148 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Fgf1P61148 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Fgf1P61148 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Fgf1P61148 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Fgf1P61148 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Fgf1P61148 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Fgf1P61148 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Fgf1P61148 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Fgf1P61148 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Fgf1P61148 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Fgf1P61148 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Fgf1P61148 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Fgf1P61148 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Fgf1P61148 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Fgf1P61148 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Fgf1P61148 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Fgf1P61148 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Fgf1P61148 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Fgf1P61148 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Fgf1P61148 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Fgf1P61148 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Fgf1P61148 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Fgf1P61148 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Fgf1P61148 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Fgf1P61148 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Fgf1P61148 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Fgf1P61148 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Fgf1P61148 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Fgf1P61148 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms