Protein–RNA interactions for Protein: P61092

Siah1a, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1A, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah1aP61092 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Siah1aP61092 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Siah1aP61092 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Siah1aP61092 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Siah1aP61092 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Siah1aP61092 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Siah1aP61092 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Siah1aP61092 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Siah1aP61092 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Siah1aP61092 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Siah1aP61092 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Siah1aP61092 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Siah1aP61092 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Siah1aP61092 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Siah1aP61092 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Siah1aP61092 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Siah1aP61092 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
Siah1aP61092 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Siah1aP61092 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Siah1aP61092 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Siah1aP61092 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Siah1aP61092 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Siah1aP61092 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Siah1aP61092 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Siah1aP61092 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Siah1aP61092 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
Siah1aP61092 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Siah1aP61092 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Siah1aP61092 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Siah1aP61092 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Siah1aP61092 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Siah1aP61092 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Siah1aP61092 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Siah1aP61092 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Siah1aP61092 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Siah1aP61092 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Siah1aP61092 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Siah1aP61092 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Siah1aP61092 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Siah1aP61092 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Siah1aP61092 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Siah1aP61092 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Siah1aP61092 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Siah1aP61092 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Siah1aP61092 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Siah1aP61092 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Siah1aP61092 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Siah1aP61092 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Siah1aP61092 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Siah1aP61092 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Siah1aP61092 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Siah1aP61092 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Siah1aP61092 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Siah1aP61092 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Siah1aP61092 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Siah1aP61092 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Siah1aP61092 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Siah1aP61092 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Siah1aP61092 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Siah1aP61092 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Siah1aP61092 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
Siah1aP61092 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Siah1aP61092 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Siah1aP61092 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Siah1aP61092 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Siah1aP61092 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Siah1aP61092 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Siah1aP61092 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Siah1aP61092 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Siah1aP61092 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Siah1aP61092 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Siah1aP61092 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Siah1aP61092 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Siah1aP61092 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Siah1aP61092 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Siah1aP61092 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Siah1aP61092 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Siah1aP61092 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Siah1aP61092 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Siah1aP61092 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Siah1aP61092 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Siah1aP61092 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Siah1aP61092 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Siah1aP61092 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Siah1aP61092 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Siah1aP61092 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Siah1aP61092 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Siah1aP61092 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Siah1aP61092 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Siah1aP61092 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Siah1aP61092 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Siah1aP61092 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Siah1aP61092 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Siah1aP61092 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Siah1aP61092 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Siah1aP61092 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Siah1aP61092 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Siah1aP61092 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Siah1aP61092 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Siah1aP61092 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms