Protein–RNA interactions for Protein: P59913

Pcmtd1, Protein-L-isoaspartate O-methyltransferase domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcmtd1P59913 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Pcmtd1P59913 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Pcmtd1P59913 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Pcmtd1P59913 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Pcmtd1P59913 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Pcmtd1P59913 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Pcmtd1P59913 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Pcmtd1P59913 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Pcmtd1P59913 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Pcmtd1P59913 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Pcmtd1P59913 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Pcmtd1P59913 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Pcmtd1P59913 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Pcmtd1P59913 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Pcmtd1P59913 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Pcmtd1P59913 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Pcmtd1P59913 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Pcmtd1P59913 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Pcmtd1P59913 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Pcmtd1P59913 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Pcmtd1P59913 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
Pcmtd1P59913 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
Pcmtd1P59913 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
Pcmtd1P59913 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Pcmtd1P59913 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Pcmtd1P59913 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Pcmtd1P59913 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Pcmtd1P59913 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
Pcmtd1P59913 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Pcmtd1P59913 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Pcmtd1P59913 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Pcmtd1P59913 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Pcmtd1P59913 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Pcmtd1P59913 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Pcmtd1P59913 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Pcmtd1P59913 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Pcmtd1P59913 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Pcmtd1P59913 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Pcmtd1P59913 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Pcmtd1P59913 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Pcmtd1P59913 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Pcmtd1P59913 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Pcmtd1P59913 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Pcmtd1P59913 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Pcmtd1P59913 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Pcmtd1P59913 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Pcmtd1P59913 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Pcmtd1P59913 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Pcmtd1P59913 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Pcmtd1P59913 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Pcmtd1P59913 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Pcmtd1P59913 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Pcmtd1P59913 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Pcmtd1P59913 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Pcmtd1P59913 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Pcmtd1P59913 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Pcmtd1P59913 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Pcmtd1P59913 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Pcmtd1P59913 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Pcmtd1P59913 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Pcmtd1P59913 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Pcmtd1P59913 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Pcmtd1P59913 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Pcmtd1P59913 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Pcmtd1P59913 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Pcmtd1P59913 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Pcmtd1P59913 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Pcmtd1P59913 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Pcmtd1P59913 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Pcmtd1P59913 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Pcmtd1P59913 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Pcmtd1P59913 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Pcmtd1P59913 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Pcmtd1P59913 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Pcmtd1P59913 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Pcmtd1P59913 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Pcmtd1P59913 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Pcmtd1P59913 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Pcmtd1P59913 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Pcmtd1P59913 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Pcmtd1P59913 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Pcmtd1P59913 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Pcmtd1P59913 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Pcmtd1P59913 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Pcmtd1P59913 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Pcmtd1P59913 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Pcmtd1P59913 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Pcmtd1P59913 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Pcmtd1P59913 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Pcmtd1P59913 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Pcmtd1P59913 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Pcmtd1P59913 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Pcmtd1P59913 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Pcmtd1P59913 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Pcmtd1P59913 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Pcmtd1P59913 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Pcmtd1P59913 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Pcmtd1P59913 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Pcmtd1P59913 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Pcmtd1P59913 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.9 ms