Protein–RNA interactions for Protein: P59470

Polr3b, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC2, mousemouse

Predictions only

Length 1,133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr3bP59470 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Polr3bP59470 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Polr3bP59470 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Polr3bP59470 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Polr3bP59470 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Polr3bP59470 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Polr3bP59470 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Polr3bP59470 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Polr3bP59470 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Polr3bP59470 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Polr3bP59470 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Polr3bP59470 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Polr3bP59470 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Polr3bP59470 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Polr3bP59470 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Polr3bP59470 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Polr3bP59470 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Polr3bP59470 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Polr3bP59470 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Polr3bP59470 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Polr3bP59470 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Polr3bP59470 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Polr3bP59470 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Polr3bP59470 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Polr3bP59470 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Polr3bP59470 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Polr3bP59470 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Polr3bP59470 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Polr3bP59470 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Polr3bP59470 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Polr3bP59470 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Polr3bP59470 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Polr3bP59470 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Polr3bP59470 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Polr3bP59470 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Polr3bP59470 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Polr3bP59470 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Polr3bP59470 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Polr3bP59470 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Polr3bP59470 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Polr3bP59470 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Polr3bP59470 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Polr3bP59470 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Polr3bP59470 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Polr3bP59470 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Polr3bP59470 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Polr3bP59470 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Polr3bP59470 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Polr3bP59470 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Polr3bP59470 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Polr3bP59470 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Polr3bP59470 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Polr3bP59470 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Polr3bP59470 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Polr3bP59470 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Polr3bP59470 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Polr3bP59470 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Polr3bP59470 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Polr3bP59470 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Polr3bP59470 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Polr3bP59470 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Polr3bP59470 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Polr3bP59470 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Polr3bP59470 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Polr3bP59470 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Polr3bP59470 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Polr3bP59470 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Polr3bP59470 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Polr3bP59470 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Polr3bP59470 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Polr3bP59470 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Polr3bP59470 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Polr3bP59470 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Polr3bP59470 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Polr3bP59470 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Polr3bP59470 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Polr3bP59470 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Polr3bP59470 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Polr3bP59470 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Polr3bP59470 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Polr3bP59470 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Polr3bP59470 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Polr3bP59470 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Polr3bP59470 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Polr3bP59470 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Polr3bP59470 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Polr3bP59470 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Polr3bP59470 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Polr3bP59470 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Polr3bP59470 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Polr3bP59470 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Polr3bP59470 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Polr3bP59470 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Polr3bP59470 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Polr3bP59470 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Polr3bP59470 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Polr3bP59470 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Polr3bP59470 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Polr3bP59470 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Polr3bP59470 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms