Protein–RNA interactions for Protein: P58686

UPF0184 protein C9orf16 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P58686 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
P58686 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
P58686 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
P58686 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
P58686 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
P58686 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
P58686 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
P58686 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
P58686 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
P58686 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
P58686 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
P58686 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
P58686 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
P58686 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
P58686 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.66
P58686 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
P58686 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
P58686 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
P58686 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
P58686 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
P58686 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
P58686 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
P58686 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
P58686 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
P58686 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
P58686 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
P58686 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
P58686 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
P58686 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
P58686 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
P58686 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
P58686 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
P58686 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
P58686 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
P58686 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
P58686 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
P58686 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
P58686 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
P58686 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
P58686 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
P58686 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
P58686 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
P58686 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
P58686 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
P58686 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
P58686 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
P58686 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
P58686 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
P58686 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
P58686 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
P58686 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
P58686 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
P58686 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
P58686 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
P58686 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
P58686 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
P58686 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
P58686 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
P58686 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
P58686 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
P58686 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
P58686 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
P58686 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
P58686 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
P58686 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
P58686 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
P58686 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
P58686 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
P58686 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
P58686 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
P58686 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
P58686 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
P58686 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
P58686 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
P58686 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
P58686 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
P58686 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
P58686 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
P58686 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
P58686 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
P58686 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
P58686 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
P58686 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
P58686 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
P58686 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
P58686 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
P58686 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
P58686 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
P58686 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
P58686 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
P58686 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC19■□□□□ 0.63
P58686 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
P58686 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
P58686 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
P58686 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
P58686 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
P58686 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
P58686 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
P58686 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
P58686 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 101.2 ms