Protein–RNA interactions for Protein: P54846

Nrl, Neural retina-specific leucine zipper protein, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NrlP54846 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NrlP54846 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NrlP54846 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NrlP54846 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NrlP54846 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NrlP54846 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
NrlP54846 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NrlP54846 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
NrlP54846 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
NrlP54846 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NrlP54846 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NrlP54846 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NrlP54846 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NrlP54846 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NrlP54846 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NrlP54846 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NrlP54846 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NrlP54846 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NrlP54846 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NrlP54846 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NrlP54846 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NrlP54846 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NrlP54846 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NrlP54846 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NrlP54846 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NrlP54846 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NrlP54846 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NrlP54846 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NrlP54846 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NrlP54846 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NrlP54846 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NrlP54846 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
NrlP54846 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NrlP54846 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
NrlP54846 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NrlP54846 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NrlP54846 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NrlP54846 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NrlP54846 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NrlP54846 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NrlP54846 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NrlP54846 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NrlP54846 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NrlP54846 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NrlP54846 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NrlP54846 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
NrlP54846 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NrlP54846 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NrlP54846 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NrlP54846 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NrlP54846 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NrlP54846 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NrlP54846 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NrlP54846 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NrlP54846 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NrlP54846 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NrlP54846 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NrlP54846 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NrlP54846 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NrlP54846 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NrlP54846 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NrlP54846 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
NrlP54846 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NrlP54846 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NrlP54846 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NrlP54846 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NrlP54846 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NrlP54846 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NrlP54846 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NrlP54846 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NrlP54846 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NrlP54846 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NrlP54846 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NrlP54846 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NrlP54846 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NrlP54846 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
NrlP54846 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NrlP54846 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NrlP54846 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NrlP54846 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NrlP54846 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NrlP54846 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
NrlP54846 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NrlP54846 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NrlP54846 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NrlP54846 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
NrlP54846 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NrlP54846 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NrlP54846 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
NrlP54846 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NrlP54846 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NrlP54846 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NrlP54846 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
NrlP54846 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NrlP54846 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NrlP54846 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NrlP54846 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NrlP54846 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NrlP54846 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
NrlP54846 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms