Protein–RNA interactions for Protein: P54754

Ephb3, Ephrin type-B receptor 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 993 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ephb3P54754 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ephb3P54754 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ephb3P54754 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ephb3P54754 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ephb3P54754 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ephb3P54754 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ephb3P54754 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ephb3P54754 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ephb3P54754 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ephb3P54754 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ephb3P54754 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ephb3P54754 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ephb3P54754 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ephb3P54754 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ephb3P54754 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ephb3P54754 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Ephb3P54754 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ephb3P54754 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ephb3P54754 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ephb3P54754 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ephb3P54754 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ephb3P54754 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ephb3P54754 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ephb3P54754 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ephb3P54754 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ephb3P54754 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ephb3P54754 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ephb3P54754 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ephb3P54754 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ephb3P54754 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ephb3P54754 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ephb3P54754 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ephb3P54754 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ephb3P54754 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ephb3P54754 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ephb3P54754 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ephb3P54754 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ephb3P54754 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ephb3P54754 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ephb3P54754 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ephb3P54754 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ephb3P54754 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ephb3P54754 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ephb3P54754 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ephb3P54754 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Ephb3P54754 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ephb3P54754 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Ephb3P54754 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ephb3P54754 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ephb3P54754 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ephb3P54754 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ephb3P54754 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ephb3P54754 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ephb3P54754 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ephb3P54754 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ephb3P54754 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ephb3P54754 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ephb3P54754 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ephb3P54754 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ephb3P54754 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ephb3P54754 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ephb3P54754 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ephb3P54754 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Ephb3P54754 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ephb3P54754 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ephb3P54754 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ephb3P54754 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ephb3P54754 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ephb3P54754 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ephb3P54754 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ephb3P54754 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ephb3P54754 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ephb3P54754 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ephb3P54754 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ephb3P54754 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ephb3P54754 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ephb3P54754 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ephb3P54754 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Ephb3P54754 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ephb3P54754 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ephb3P54754 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ephb3P54754 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ephb3P54754 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ephb3P54754 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ephb3P54754 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ephb3P54754 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ephb3P54754 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ephb3P54754 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ephb3P54754 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ephb3P54754 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ephb3P54754 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ephb3P54754 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ephb3P54754 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ephb3P54754 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ephb3P54754 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ephb3P54754 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ephb3P54754 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ephb3P54754 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ephb3P54754 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ephb3P54754 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms