Protein–RNA interactions for Protein: P53986

Slc16a1, Monocarboxylate transporter 1, mousemouse

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc16a1P53986 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Slc16a1P53986 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Slc16a1P53986 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Slc16a1P53986 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Slc16a1P53986 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Slc16a1P53986 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Slc16a1P53986 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Slc16a1P53986 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Slc16a1P53986 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Slc16a1P53986 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Slc16a1P53986 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Slc16a1P53986 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Slc16a1P53986 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Slc16a1P53986 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Slc16a1P53986 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Slc16a1P53986 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Slc16a1P53986 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Slc16a1P53986 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Slc16a1P53986 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Slc16a1P53986 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Slc16a1P53986 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Slc16a1P53986 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Slc16a1P53986 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Slc16a1P53986 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Slc16a1P53986 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Slc16a1P53986 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Slc16a1P53986 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Slc16a1P53986 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Slc16a1P53986 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Slc16a1P53986 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Slc16a1P53986 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Slc16a1P53986 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Slc16a1P53986 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Slc16a1P53986 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Slc16a1P53986 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Slc16a1P53986 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Slc16a1P53986 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Slc16a1P53986 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Slc16a1P53986 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Slc16a1P53986 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Slc16a1P53986 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Slc16a1P53986 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Slc16a1P53986 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Slc16a1P53986 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Slc16a1P53986 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Slc16a1P53986 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Slc16a1P53986 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Slc16a1P53986 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Slc16a1P53986 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Slc16a1P53986 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Slc16a1P53986 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Slc16a1P53986 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Slc16a1P53986 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Slc16a1P53986 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Slc16a1P53986 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Slc16a1P53986 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Slc16a1P53986 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Slc16a1P53986 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Slc16a1P53986 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Slc16a1P53986 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Slc16a1P53986 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Slc16a1P53986 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Slc16a1P53986 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Slc16a1P53986 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Slc16a1P53986 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Slc16a1P53986 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Slc16a1P53986 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Slc16a1P53986 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Slc16a1P53986 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Slc16a1P53986 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Slc16a1P53986 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Slc16a1P53986 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Slc16a1P53986 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Slc16a1P53986 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Slc16a1P53986 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Slc16a1P53986 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Slc16a1P53986 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Slc16a1P53986 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Slc16a1P53986 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Slc16a1P53986 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Slc16a1P53986 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Slc16a1P53986 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Slc16a1P53986 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Slc16a1P53986 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Slc16a1P53986 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Slc16a1P53986 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Slc16a1P53986 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Slc16a1P53986 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Slc16a1P53986 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Slc16a1P53986 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Slc16a1P53986 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Slc16a1P53986 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Slc16a1P53986 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Slc16a1P53986 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Slc16a1P53986 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Slc16a1P53986 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Slc16a1P53986 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Slc16a1P53986 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Slc16a1P53986 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Slc16a1P53986 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms