Protein–RNA interactions for Protein: P53566

Cebpa, CCAAT/enhancer-binding protein alpha, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CebpaP53566 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CebpaP53566 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CebpaP53566 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CebpaP53566 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CebpaP53566 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CebpaP53566 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CebpaP53566 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CebpaP53566 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CebpaP53566 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CebpaP53566 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CebpaP53566 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CebpaP53566 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CebpaP53566 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CebpaP53566 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CebpaP53566 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
CebpaP53566 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CebpaP53566 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CebpaP53566 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CebpaP53566 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CebpaP53566 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CebpaP53566 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CebpaP53566 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CebpaP53566 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CebpaP53566 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
CebpaP53566 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CebpaP53566 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CebpaP53566 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CebpaP53566 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CebpaP53566 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CebpaP53566 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CebpaP53566 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
CebpaP53566 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CebpaP53566 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
CebpaP53566 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CebpaP53566 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CebpaP53566 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CebpaP53566 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CebpaP53566 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
CebpaP53566 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CebpaP53566 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CebpaP53566 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
CebpaP53566 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CebpaP53566 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CebpaP53566 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CebpaP53566 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CebpaP53566 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CebpaP53566 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
CebpaP53566 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CebpaP53566 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CebpaP53566 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CebpaP53566 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CebpaP53566 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CebpaP53566 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CebpaP53566 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CebpaP53566 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CebpaP53566 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CebpaP53566 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CebpaP53566 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CebpaP53566 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CebpaP53566 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CebpaP53566 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CebpaP53566 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CebpaP53566 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CebpaP53566 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CebpaP53566 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CebpaP53566 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CebpaP53566 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CebpaP53566 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CebpaP53566 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CebpaP53566 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CebpaP53566 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CebpaP53566 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CebpaP53566 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CebpaP53566 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CebpaP53566 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
CebpaP53566 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CebpaP53566 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CebpaP53566 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CebpaP53566 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CebpaP53566 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CebpaP53566 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CebpaP53566 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CebpaP53566 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CebpaP53566 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
CebpaP53566 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CebpaP53566 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CebpaP53566 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CebpaP53566 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CebpaP53566 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CebpaP53566 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CebpaP53566 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CebpaP53566 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CebpaP53566 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
CebpaP53566 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CebpaP53566 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CebpaP53566 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CebpaP53566 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CebpaP53566 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CebpaP53566 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CebpaP53566 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.9 ms