Protein–RNA interactions for Protein: P52793

Efna1, Ephrin-A1, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efna1P52793 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Efna1P52793 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Efna1P52793 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Efna1P52793 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Efna1P52793 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Efna1P52793 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Efna1P52793 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Efna1P52793 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Efna1P52793 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Efna1P52793 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Efna1P52793 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Efna1P52793 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Efna1P52793 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Efna1P52793 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Efna1P52793 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Efna1P52793 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Efna1P52793 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Efna1P52793 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Efna1P52793 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Efna1P52793 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Efna1P52793 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Efna1P52793 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Efna1P52793 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Efna1P52793 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Efna1P52793 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Efna1P52793 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Efna1P52793 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Efna1P52793 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Efna1P52793 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Efna1P52793 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Efna1P52793 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Efna1P52793 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Efna1P52793 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Efna1P52793 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Efna1P52793 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Efna1P52793 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Efna1P52793 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Efna1P52793 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Efna1P52793 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Efna1P52793 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Efna1P52793 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Efna1P52793 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Efna1P52793 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Efna1P52793 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Efna1P52793 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Efna1P52793 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Efna1P52793 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Efna1P52793 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Efna1P52793 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Efna1P52793 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Efna1P52793 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Efna1P52793 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Efna1P52793 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Efna1P52793 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Efna1P52793 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Efna1P52793 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Efna1P52793 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Efna1P52793 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Efna1P52793 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Efna1P52793 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Efna1P52793 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Efna1P52793 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Efna1P52793 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Efna1P52793 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Efna1P52793 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Efna1P52793 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Efna1P52793 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
Efna1P52793 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Efna1P52793 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Efna1P52793 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Efna1P52793 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Efna1P52793 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Efna1P52793 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Efna1P52793 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Efna1P52793 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Efna1P52793 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Efna1P52793 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Efna1P52793 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Efna1P52793 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Efna1P52793 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Efna1P52793 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Efna1P52793 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Efna1P52793 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Efna1P52793 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Efna1P52793 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Efna1P52793 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Efna1P52793 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Efna1P52793 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Efna1P52793 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Efna1P52793 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Efna1P52793 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Efna1P52793 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Efna1P52793 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Efna1P52793 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Efna1P52793 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Efna1P52793 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Efna1P52793 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Efna1P52793 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Efna1P52793 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Efna1P52793 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms