Protein–RNA interactions for Protein: P51910

Apod, Apolipoprotein D, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApodP51910 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ApodP51910 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ApodP51910 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ApodP51910 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
ApodP51910 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ApodP51910 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ApodP51910 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
ApodP51910 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ApodP51910 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ApodP51910 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ApodP51910 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ApodP51910 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ApodP51910 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ApodP51910 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ApodP51910 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ApodP51910 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ApodP51910 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ApodP51910 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ApodP51910 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ApodP51910 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ApodP51910 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
ApodP51910 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ApodP51910 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ApodP51910 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ApodP51910 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ApodP51910 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ApodP51910 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ApodP51910 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
ApodP51910 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ApodP51910 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ApodP51910 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ApodP51910 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ApodP51910 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ApodP51910 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ApodP51910 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ApodP51910 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ApodP51910 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ApodP51910 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ApodP51910 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ApodP51910 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ApodP51910 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ApodP51910 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ApodP51910 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ApodP51910 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ApodP51910 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ApodP51910 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
ApodP51910 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ApodP51910 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ApodP51910 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ApodP51910 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ApodP51910 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ApodP51910 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ApodP51910 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ApodP51910 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ApodP51910 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ApodP51910 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ApodP51910 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ApodP51910 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ApodP51910 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
ApodP51910 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ApodP51910 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ApodP51910 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ApodP51910 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ApodP51910 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ApodP51910 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ApodP51910 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ApodP51910 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ApodP51910 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ApodP51910 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ApodP51910 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
ApodP51910 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ApodP51910 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
ApodP51910 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ApodP51910 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ApodP51910 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ApodP51910 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ApodP51910 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ApodP51910 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ApodP51910 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ApodP51910 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ApodP51910 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ApodP51910 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ApodP51910 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ApodP51910 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ApodP51910 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ApodP51910 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.32■■□□□ 1
ApodP51910 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ApodP51910 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ApodP51910 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ApodP51910 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
ApodP51910 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
ApodP51910 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ApodP51910 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ApodP51910 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ApodP51910 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ApodP51910 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ApodP51910 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ApodP51910 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ApodP51910 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ApodP51910 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 165.7 ms