Protein–RNA interactions for Protein: P51885

Lum, Lumican, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LumP51885 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LumP51885 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LumP51885 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LumP51885 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LumP51885 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
LumP51885 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LumP51885 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LumP51885 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LumP51885 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LumP51885 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LumP51885 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LumP51885 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LumP51885 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LumP51885 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LumP51885 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LumP51885 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LumP51885 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LumP51885 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LumP51885 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LumP51885 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
LumP51885 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
LumP51885 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
LumP51885 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
LumP51885 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
LumP51885 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
LumP51885 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
LumP51885 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LumP51885 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LumP51885 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LumP51885 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LumP51885 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LumP51885 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
LumP51885 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LumP51885 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
LumP51885 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LumP51885 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
LumP51885 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LumP51885 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
LumP51885 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
LumP51885 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
LumP51885 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
LumP51885 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
LumP51885 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
LumP51885 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
LumP51885 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
LumP51885 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
LumP51885 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
LumP51885 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
LumP51885 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
LumP51885 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
LumP51885 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
LumP51885 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
LumP51885 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
LumP51885 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
LumP51885 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21■□□□□ 0.95
LumP51885 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
LumP51885 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
LumP51885 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
LumP51885 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
LumP51885 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
LumP51885 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
LumP51885 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
LumP51885 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
LumP51885 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
LumP51885 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
LumP51885 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
LumP51885 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
LumP51885 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
LumP51885 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
LumP51885 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
LumP51885 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
LumP51885 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
LumP51885 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
LumP51885 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
LumP51885 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
LumP51885 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
LumP51885 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
LumP51885 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
LumP51885 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
LumP51885 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
LumP51885 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
LumP51885 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
LumP51885 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
LumP51885 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
LumP51885 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
LumP51885 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
LumP51885 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
LumP51885 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
LumP51885 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
LumP51885 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
LumP51885 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
LumP51885 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
LumP51885 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
LumP51885 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
LumP51885 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
LumP51885 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
LumP51885 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
LumP51885 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
LumP51885 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
LumP51885 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms