Protein–RNA interactions for Protein: P51180

Mip, Lens fiber major intrinsic protein, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MipP51180 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MipP51180 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
MipP51180 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MipP51180 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MipP51180 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MipP51180 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
MipP51180 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MipP51180 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MipP51180 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MipP51180 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MipP51180 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MipP51180 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MipP51180 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MipP51180 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MipP51180 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MipP51180 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MipP51180 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MipP51180 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MipP51180 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MipP51180 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
MipP51180 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MipP51180 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MipP51180 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MipP51180 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MipP51180 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MipP51180 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MipP51180 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MipP51180 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
MipP51180 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MipP51180 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
MipP51180 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MipP51180 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MipP51180 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MipP51180 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MipP51180 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MipP51180 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MipP51180 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MipP51180 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MipP51180 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MipP51180 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MipP51180 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MipP51180 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MipP51180 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MipP51180 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MipP51180 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MipP51180 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MipP51180 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MipP51180 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MipP51180 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MipP51180 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MipP51180 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
MipP51180 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MipP51180 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MipP51180 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MipP51180 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MipP51180 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MipP51180 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
MipP51180 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
MipP51180 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MipP51180 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MipP51180 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MipP51180 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MipP51180 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MipP51180 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MipP51180 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MipP51180 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
MipP51180 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MipP51180 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MipP51180 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
MipP51180 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MipP51180 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MipP51180 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MipP51180 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MipP51180 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MipP51180 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MipP51180 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MipP51180 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MipP51180 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MipP51180 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MipP51180 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MipP51180 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MipP51180 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
MipP51180 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MipP51180 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MipP51180 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MipP51180 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MipP51180 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
MipP51180 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MipP51180 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MipP51180 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MipP51180 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MipP51180 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MipP51180 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MipP51180 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
MipP51180 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MipP51180 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
MipP51180 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MipP51180 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MipP51180 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MipP51180 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80 ms