Protein–RNA interactions for Protein: P50711

Defa13, Alpha-defensin 13, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa13P50711 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,3■□□□□ 0,2
Defa13P50711 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,3■□□□□ 0,2
Defa13P50711 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC16,3■□□□□ 0,2
Defa13P50711 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC16,3■□□□□ 0,2
Defa13P50711 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC16,29■□□□□ 0,2
Defa13P50711 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,29■□□□□ 0,2
Defa13P50711 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16,29■□□□□ 0,2
Defa13P50711 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC16,29■□□□□ 0,2
Defa13P50711 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16,29■□□□□ 0,2
Defa13P50711 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,29■□□□□ 0,2
Defa13P50711 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16,29■□□□□ 0,2
Defa13P50711 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,28■□□□□ 0,2
Defa13P50711 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16,28■□□□□ 0,2
Defa13P50711 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC16,28■□□□□ 0,2
Defa13P50711 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16,28■□□□□ 0,2
Defa13P50711 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,28■□□□□ 0,2
Defa13P50711 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16,28■□□□□ 0,2
Defa13P50711 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC16,28■□□□□ 0,2
Defa13P50711 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,28■□□□□ 0,2
Defa13P50711 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16,28■□□□□ 0,2
Defa13P50711 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,27■□□□□ 0,2
Defa13P50711 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,27■□□□□ 0,2
Defa13P50711 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC16,27■□□□□ 0,19
Defa13P50711 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16,27■□□□□ 0,19
Defa13P50711 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,27■□□□□ 0,19
Defa13P50711 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16,26■□□□□ 0,19
Defa13P50711 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16,26■□□□□ 0,19
Defa13P50711 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16,26■□□□□ 0,19
Defa13P50711 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16,25■□□□□ 0,19
Defa13P50711 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16,25■□□□□ 0,19
Defa13P50711 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16,25■□□□□ 0,19
Defa13P50711 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16,25■□□□□ 0,19
Defa13P50711 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16,25■□□□□ 0,19
Defa13P50711 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,25■□□□□ 0,19
Defa13P50711 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,25■□□□□ 0,19
Defa13P50711 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,24■□□□□ 0,19
Defa13P50711 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,24■□□□□ 0,19
Defa13P50711 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16,24■□□□□ 0,19
Defa13P50711 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16,24■□□□□ 0,19
Defa13P50711 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16,24■□□□□ 0,19
Defa13P50711 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,24■□□□□ 0,19
Defa13P50711 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,23■□□□□ 0,19
Defa13P50711 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,23■□□□□ 0,19
Defa13P50711 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16,23■□□□□ 0,19
Defa13P50711 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16,23■□□□□ 0,19
Defa13P50711 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16,23■□□□□ 0,19
Defa13P50711 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16,23■□□□□ 0,19
Defa13P50711 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,23■□□□□ 0,19
Defa13P50711 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16,23■□□□□ 0,19
Defa13P50711 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16,23■□□□□ 0,19
Defa13P50711 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,22■□□□□ 0,19
Defa13P50711 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,22■□□□□ 0,19
Defa13P50711 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16,21■□□□□ 0,19
Defa13P50711 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16,21■□□□□ 0,19
Defa13P50711 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,21■□□□□ 0,19
Defa13P50711 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16,21■□□□□ 0,19
Defa13P50711 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16,21■□□□□ 0,18
Defa13P50711 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,2■□□□□ 0,18
Defa13P50711 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16,2■□□□□ 0,18
Defa13P50711 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,2■□□□□ 0,18
Defa13P50711 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,2■□□□□ 0,18
Defa13P50711 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16,2■□□□□ 0,18
Defa13P50711 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,19■□□□□ 0,18
Defa13P50711 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,19■□□□□ 0,18
Defa13P50711 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,19■□□□□ 0,18
Defa13P50711 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,19■□□□□ 0,18
Defa13P50711 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,19■□□□□ 0,18
Defa13P50711 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,19■□□□□ 0,18
Defa13P50711 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16,18■□□□□ 0,18
Defa13P50711 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16,18■□□□□ 0,18
Defa13P50711 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,18■□□□□ 0,18
Defa13P50711 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16,18■□□□□ 0,18
Defa13P50711 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16,18■□□□□ 0,18
Defa13P50711 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16,18■□□□□ 0,18
Defa13P50711 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,18■□□□□ 0,18
Defa13P50711 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16,18■□□□□ 0,18
Defa13P50711 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,18■□□□□ 0,18
Defa13P50711 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,17■□□□□ 0,18
Defa13P50711 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC16,16■□□□□ 0,18
Defa13P50711 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16,16■□□□□ 0,18
Defa13P50711 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16,16■□□□□ 0,18
Defa13P50711 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC16,16■□□□□ 0,18
Defa13P50711 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC16,16■□□□□ 0,18
Defa13P50711 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC16,16■□□□□ 0,18
Defa13P50711 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,16■□□□□ 0,18
Defa13P50711 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,16■□□□□ 0,18
Defa13P50711 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16,16■□□□□ 0,18
Defa13P50711 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16,15■□□□□ 0,18
Defa13P50711 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,15■□□□□ 0,18
Defa13P50711 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,15■□□□□ 0,18
Defa13P50711 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16,15■□□□□ 0,18
Defa13P50711 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,15■□□□□ 0,18
Defa13P50711 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16,14■□□□□ 0,17
Defa13P50711 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16,14■□□□□ 0,17
Defa13P50711 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16,14■□□□□ 0,17
Defa13P50711 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,14■□□□□ 0,17
Defa13P50711 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,14■□□□□ 0,17
Defa13P50711 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,13■□□□□ 0,17
Defa13P50711 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16,13■□□□□ 0,17
Defa13P50711 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC16,13■□□□□ 0,17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19,1 ms