Protein–RNA interactions for Protein: P49766

Vegfb, Vascular endothelial growth factor B, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VegfbP49766 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
VegfbP49766 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
VegfbP49766 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
VegfbP49766 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
VegfbP49766 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
VegfbP49766 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
VegfbP49766 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
VegfbP49766 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
VegfbP49766 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
VegfbP49766 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
VegfbP49766 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
VegfbP49766 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
VegfbP49766 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
VegfbP49766 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
VegfbP49766 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
VegfbP49766 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
VegfbP49766 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
VegfbP49766 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
VegfbP49766 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
VegfbP49766 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
VegfbP49766 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
VegfbP49766 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
VegfbP49766 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
VegfbP49766 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
VegfbP49766 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
VegfbP49766 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
VegfbP49766 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
VegfbP49766 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
VegfbP49766 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
VegfbP49766 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
VegfbP49766 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
VegfbP49766 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
VegfbP49766 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
VegfbP49766 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
VegfbP49766 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
VegfbP49766 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
VegfbP49766 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
VegfbP49766 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
VegfbP49766 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
VegfbP49766 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
VegfbP49766 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
VegfbP49766 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
VegfbP49766 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
VegfbP49766 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
VegfbP49766 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
VegfbP49766 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
VegfbP49766 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
VegfbP49766 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
VegfbP49766 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
VegfbP49766 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
VegfbP49766 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
VegfbP49766 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
VegfbP49766 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
VegfbP49766 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
VegfbP49766 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
VegfbP49766 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
VegfbP49766 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
VegfbP49766 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
VegfbP49766 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
VegfbP49766 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
VegfbP49766 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
VegfbP49766 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
VegfbP49766 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
VegfbP49766 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
VegfbP49766 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
VegfbP49766 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
VegfbP49766 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
VegfbP49766 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
VegfbP49766 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
VegfbP49766 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
VegfbP49766 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
VegfbP49766 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
VegfbP49766 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
VegfbP49766 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
VegfbP49766 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
VegfbP49766 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
VegfbP49766 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
VegfbP49766 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
VegfbP49766 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
VegfbP49766 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
VegfbP49766 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
VegfbP49766 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
VegfbP49766 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
VegfbP49766 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
VegfbP49766 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
VegfbP49766 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
VegfbP49766 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
VegfbP49766 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
VegfbP49766 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
VegfbP49766 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
VegfbP49766 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
VegfbP49766 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
VegfbP49766 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
VegfbP49766 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
VegfbP49766 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
VegfbP49766 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
VegfbP49766 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
VegfbP49766 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
VegfbP49766 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
VegfbP49766 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms