Protein–RNA interactions for Protein: P49764

Pgf, Placenta growth factor, mousemouse

Predictions only

Length 158 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PgfP49764 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PgfP49764 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PgfP49764 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PgfP49764 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PgfP49764 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PgfP49764 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PgfP49764 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PgfP49764 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PgfP49764 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PgfP49764 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
PgfP49764 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PgfP49764 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PgfP49764 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PgfP49764 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PgfP49764 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PgfP49764 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PgfP49764 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
PgfP49764 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
PgfP49764 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PgfP49764 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PgfP49764 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PgfP49764 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PgfP49764 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PgfP49764 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PgfP49764 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PgfP49764 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PgfP49764 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PgfP49764 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PgfP49764 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
PgfP49764 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PgfP49764 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PgfP49764 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PgfP49764 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PgfP49764 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PgfP49764 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PgfP49764 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PgfP49764 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PgfP49764 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PgfP49764 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PgfP49764 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PgfP49764 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PgfP49764 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PgfP49764 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
PgfP49764 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PgfP49764 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PgfP49764 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PgfP49764 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PgfP49764 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
PgfP49764 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
PgfP49764 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
PgfP49764 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PgfP49764 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PgfP49764 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
PgfP49764 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PgfP49764 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PgfP49764 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PgfP49764 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PgfP49764 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PgfP49764 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
PgfP49764 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PgfP49764 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PgfP49764 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PgfP49764 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PgfP49764 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PgfP49764 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PgfP49764 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PgfP49764 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PgfP49764 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PgfP49764 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
PgfP49764 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PgfP49764 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PgfP49764 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PgfP49764 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PgfP49764 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PgfP49764 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PgfP49764 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PgfP49764 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PgfP49764 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PgfP49764 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PgfP49764 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PgfP49764 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PgfP49764 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PgfP49764 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PgfP49764 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PgfP49764 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PgfP49764 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PgfP49764 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PgfP49764 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PgfP49764 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PgfP49764 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PgfP49764 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PgfP49764 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PgfP49764 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PgfP49764 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PgfP49764 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PgfP49764 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PgfP49764 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PgfP49764 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PgfP49764 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PgfP49764 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms