Protein–RNA interactions for Protein: P48410

Abcd1, ATP-binding cassette sub-family D member 1, mousemouse

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcd1P48410 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24,8■■□□□ 1,56
Abcd1P48410 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,8■■□□□ 1,56
Abcd1P48410 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC24,79■■□□□ 1,56
Abcd1P48410 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,79■■□□□ 1,56
Abcd1P48410 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,79■■□□□ 1,56
Abcd1P48410 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,78■■□□□ 1,56
Abcd1P48410 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,78■■□□□ 1,56
Abcd1P48410 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24,78■■□□□ 1,56
Abcd1P48410 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,77■■□□□ 1,56
Abcd1P48410 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,77■■□□□ 1,56
Abcd1P48410 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24,77■■□□□ 1,56
Abcd1P48410 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24,77■■□□□ 1,56
Abcd1P48410 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,77■■□□□ 1,56
Abcd1P48410 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,77■■□□□ 1,56
Abcd1P48410 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24,77■■□□□ 1,56
Abcd1P48410 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,77■■□□□ 1,56
Abcd1P48410 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24,76■■□□□ 1,56
Abcd1P48410 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,76■■□□□ 1,55
Abcd1P48410 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,76■■□□□ 1,55
Abcd1P48410 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,76■■□□□ 1,55
Abcd1P48410 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24,76■■□□□ 1,55
Abcd1P48410 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,75■■□□□ 1,55
Abcd1P48410 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,75■■□□□ 1,55
Abcd1P48410 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24,75■■□□□ 1,55
Abcd1P48410 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,74■■□□□ 1,55
Abcd1P48410 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24,74■■□□□ 1,55
Abcd1P48410 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC24,74■■□□□ 1,55
Abcd1P48410 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,74■■□□□ 1,55
Abcd1P48410 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,73■■□□□ 1,55
Abcd1P48410 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24,73■■□□□ 1,55
Abcd1P48410 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24,73■■□□□ 1,55
Abcd1P48410 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24,72■■□□□ 1,55
Abcd1P48410 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24,72■■□□□ 1,55
Abcd1P48410 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,72■■□□□ 1,55
Abcd1P48410 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,72■■□□□ 1,55
Abcd1P48410 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,71■■□□□ 1,55
Abcd1P48410 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,71■■□□□ 1,55
Abcd1P48410 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,71■■□□□ 1,55
Abcd1P48410 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,71■■□□□ 1,55
Abcd1P48410 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24,71■■□□□ 1,55
Abcd1P48410 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,71■■□□□ 1,55
Abcd1P48410 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,71■■□□□ 1,55
Abcd1P48410 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC24,7■■□□□ 1,55
Abcd1P48410 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC24,7■■□□□ 1,54
Abcd1P48410 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24,7■■□□□ 1,54
Abcd1P48410 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,69■■□□□ 1,54
Abcd1P48410 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24,69■■□□□ 1,54
Abcd1P48410 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,69■■□□□ 1,54
Abcd1P48410 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24,68■■□□□ 1,54
Abcd1P48410 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,68■■□□□ 1,54
Abcd1P48410 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,68■■□□□ 1,54
Abcd1P48410 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24,68■■□□□ 1,54
Abcd1P48410 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,68■■□□□ 1,54
Abcd1P48410 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,68■■□□□ 1,54
Abcd1P48410 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,68■■□□□ 1,54
Abcd1P48410 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24,68■■□□□ 1,54
Abcd1P48410 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,67■■□□□ 1,54
Abcd1P48410 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24,66■■□□□ 1,54
Abcd1P48410 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24,66■■□□□ 1,54
Abcd1P48410 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,66■■□□□ 1,54
Abcd1P48410 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24,65■■□□□ 1,54
Abcd1P48410 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,65■■□□□ 1,54
Abcd1P48410 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC24,65■■□□□ 1,54
Abcd1P48410 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24,65■■□□□ 1,54
Abcd1P48410 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24,65■■□□□ 1,54
Abcd1P48410 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,64■■□□□ 1,54
Abcd1P48410 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24,64■■□□□ 1,54
Abcd1P48410 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24,64■■□□□ 1,53
Abcd1P48410 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC24,64■■□□□ 1,53
Abcd1P48410 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24,64■■□□□ 1,53
Abcd1P48410 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,64■■□□□ 1,53
Abcd1P48410 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24,64■■□□□ 1,53
Abcd1P48410 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,64■■□□□ 1,53
Abcd1P48410 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC24,64■■□□□ 1,53
Abcd1P48410 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,63■■□□□ 1,53
Abcd1P48410 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,63■■□□□ 1,53
Abcd1P48410 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC24,63■■□□□ 1,53
Abcd1P48410 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,63■■□□□ 1,53
Abcd1P48410 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,63■■□□□ 1,53
Abcd1P48410 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24,63■■□□□ 1,53
Abcd1P48410 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,63■■□□□ 1,53
Abcd1P48410 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24,62■■□□□ 1,53
Abcd1P48410 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24,62■■□□□ 1,53
Abcd1P48410 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24,62■■□□□ 1,53
Abcd1P48410 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC24,62■■□□□ 1,53
Abcd1P48410 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,62■■□□□ 1,53
Abcd1P48410 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC24,62■■□□□ 1,53
Abcd1P48410 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24,61■■□□□ 1,53
Abcd1P48410 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24,61■■□□□ 1,53
Abcd1P48410 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,61■■□□□ 1,53
Abcd1P48410 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC24,61■■□□□ 1,53
Abcd1P48410 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,61■■□□□ 1,53
Abcd1P48410 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,61■■□□□ 1,53
Abcd1P48410 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC24,6■■□□□ 1,53
Abcd1P48410 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC24,6■■□□□ 1,53
Abcd1P48410 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC24,6■■□□□ 1,53
Abcd1P48410 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,6■■□□□ 1,53
Abcd1P48410 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,59■■□□□ 1,53
Abcd1P48410 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC24,59■■□□□ 1,53
Abcd1P48410 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,59■■□□□ 1,53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32,3 ms