Protein–RNA interactions for Protein: P48031

Gbx2, Homeobox protein GBX-2, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbx2P48031 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gbx2P48031 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gbx2P48031 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gbx2P48031 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gbx2P48031 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gbx2P48031 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gbx2P48031 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Gbx2P48031 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gbx2P48031 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gbx2P48031 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gbx2P48031 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gbx2P48031 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gbx2P48031 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gbx2P48031 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gbx2P48031 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gbx2P48031 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gbx2P48031 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gbx2P48031 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gbx2P48031 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gbx2P48031 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gbx2P48031 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gbx2P48031 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gbx2P48031 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gbx2P48031 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gbx2P48031 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gbx2P48031 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gbx2P48031 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gbx2P48031 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gbx2P48031 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Gbx2P48031 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gbx2P48031 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Gbx2P48031 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Gbx2P48031 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Gbx2P48031 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Gbx2P48031 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Gbx2P48031 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Gbx2P48031 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Gbx2P48031 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Gbx2P48031 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Gbx2P48031 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gbx2P48031 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gbx2P48031 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gbx2P48031 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gbx2P48031 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gbx2P48031 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gbx2P48031 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gbx2P48031 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gbx2P48031 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gbx2P48031 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gbx2P48031 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gbx2P48031 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gbx2P48031 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Gbx2P48031 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gbx2P48031 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gbx2P48031 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gbx2P48031 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gbx2P48031 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gbx2P48031 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gbx2P48031 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gbx2P48031 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gbx2P48031 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gbx2P48031 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gbx2P48031 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gbx2P48031 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Gbx2P48031 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Gbx2P48031 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Gbx2P48031 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Gbx2P48031 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Gbx2P48031 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Gbx2P48031 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gbx2P48031 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gbx2P48031 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gbx2P48031 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gbx2P48031 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gbx2P48031 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gbx2P48031 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gbx2P48031 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gbx2P48031 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gbx2P48031 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gbx2P48031 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gbx2P48031 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gbx2P48031 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gbx2P48031 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gbx2P48031 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gbx2P48031 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gbx2P48031 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gbx2P48031 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gbx2P48031 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gbx2P48031 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gbx2P48031 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gbx2P48031 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gbx2P48031 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gbx2P48031 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gbx2P48031 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gbx2P48031 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gbx2P48031 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gbx2P48031 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gbx2P48031 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gbx2P48031 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gbx2P48031 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms