Protein–RNA interactions for Protein: P46099

Klf1, Krueppel-like factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf1P46099 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Klf1P46099 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Klf1P46099 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Klf1P46099 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Klf1P46099 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Klf1P46099 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Klf1P46099 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Klf1P46099 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Klf1P46099 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Klf1P46099 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Klf1P46099 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Klf1P46099 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Klf1P46099 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Klf1P46099 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Klf1P46099 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Klf1P46099 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Klf1P46099 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Klf1P46099 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Klf1P46099 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Klf1P46099 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Klf1P46099 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Klf1P46099 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Klf1P46099 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Klf1P46099 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Klf1P46099 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Klf1P46099 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Klf1P46099 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Klf1P46099 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Klf1P46099 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Klf1P46099 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Klf1P46099 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Klf1P46099 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Klf1P46099 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Klf1P46099 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Klf1P46099 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Klf1P46099 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Klf1P46099 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Klf1P46099 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Klf1P46099 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Klf1P46099 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Klf1P46099 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Klf1P46099 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Klf1P46099 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Klf1P46099 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Klf1P46099 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Klf1P46099 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Klf1P46099 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Klf1P46099 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Klf1P46099 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Klf1P46099 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Klf1P46099 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Klf1P46099 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Klf1P46099 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Klf1P46099 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Klf1P46099 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Klf1P46099 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Klf1P46099 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Klf1P46099 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Klf1P46099 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Klf1P46099 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Klf1P46099 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Klf1P46099 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Klf1P46099 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Klf1P46099 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Klf1P46099 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Klf1P46099 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Klf1P46099 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Klf1P46099 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Klf1P46099 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Klf1P46099 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Klf1P46099 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Klf1P46099 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Klf1P46099 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Klf1P46099 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Klf1P46099 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Klf1P46099 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Klf1P46099 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Klf1P46099 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Klf1P46099 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Klf1P46099 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Klf1P46099 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Klf1P46099 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Klf1P46099 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Klf1P46099 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Klf1P46099 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Klf1P46099 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Klf1P46099 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Klf1P46099 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Klf1P46099 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Klf1P46099 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Klf1P46099 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Klf1P46099 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Klf1P46099 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Klf1P46099 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Klf1P46099 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Klf1P46099 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Klf1P46099 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Klf1P46099 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Klf1P46099 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Klf1P46099 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.4 ms